Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z5M5

TMC3, Transmembrane channel-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMC3Q7Z5M5 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMC3Q7Z5M5 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMC3Q7Z5M5 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMC3Q7Z5M5 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMC3Q7Z5M5 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
TMC3Q7Z5M5 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMC3Q7Z5M5 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMC3Q7Z5M5 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMC3Q7Z5M5 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMC3Q7Z5M5 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMC3Q7Z5M5 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMC3Q7Z5M5 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMC3Q7Z5M5 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
TMC3Q7Z5M5 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMC3Q7Z5M5 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMC3Q7Z5M5 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMC3Q7Z5M5 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMC3Q7Z5M5 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMC3Q7Z5M5 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMC3Q7Z5M5 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMC3Q7Z5M5 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMC3Q7Z5M5 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMC3Q7Z5M5 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
TMC3Q7Z5M5 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMC3Q7Z5M5 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMC3Q7Z5M5 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMC3Q7Z5M5 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMC3Q7Z5M5 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMC3Q7Z5M5 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMC3Q7Z5M5 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMC3Q7Z5M5 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMC3Q7Z5M5 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMC3Q7Z5M5 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMC3Q7Z5M5 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMC3Q7Z5M5 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMC3Q7Z5M5 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMC3Q7Z5M5 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMC3Q7Z5M5 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMC3Q7Z5M5 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMC3Q7Z5M5 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMC3Q7Z5M5 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMC3Q7Z5M5 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMC3Q7Z5M5 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMC3Q7Z5M5 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMC3Q7Z5M5 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMC3Q7Z5M5 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMC3Q7Z5M5 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMC3Q7Z5M5 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMC3Q7Z5M5 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMC3Q7Z5M5 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMC3Q7Z5M5 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMC3Q7Z5M5 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMC3Q7Z5M5 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
TMC3Q7Z5M5 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMC3Q7Z5M5 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMC3Q7Z5M5 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMC3Q7Z5M5 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMC3Q7Z5M5 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMC3Q7Z5M5 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
TMC3Q7Z5M5 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMC3Q7Z5M5 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
TMC3Q7Z5M5 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMC3Q7Z5M5 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMC3Q7Z5M5 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMC3Q7Z5M5 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMC3Q7Z5M5 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMC3Q7Z5M5 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMC3Q7Z5M5 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMC3Q7Z5M5 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMC3Q7Z5M5 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMC3Q7Z5M5 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
TMC3Q7Z5M5 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMC3Q7Z5M5 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMC3Q7Z5M5 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMC3Q7Z5M5 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMC3Q7Z5M5 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMC3Q7Z5M5 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMC3Q7Z5M5 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMC3Q7Z5M5 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMC3Q7Z5M5 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMC3Q7Z5M5 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMC3Q7Z5M5 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMC3Q7Z5M5 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMC3Q7Z5M5 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMC3Q7Z5M5 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TMC3Q7Z5M5 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TMC3Q7Z5M5 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
TMC3Q7Z5M5 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TMC3Q7Z5M5 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
TMC3Q7Z5M5 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TMC3Q7Z5M5 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TMC3Q7Z5M5 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMC3Q7Z5M5 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
TMC3Q7Z5M5 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMC3Q7Z5M5 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMC3Q7Z5M5 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMC3Q7Z5M5 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMC3Q7Z5M5 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMC3Q7Z5M5 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMC3Q7Z5M5 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms