Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTS6

OTOP2, Otopetrin-2, humanhuman

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTOP2Q7RTS6 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
OTOP2Q7RTS6 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
OTOP2Q7RTS6 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
OTOP2Q7RTS6 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
OTOP2Q7RTS6 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
OTOP2Q7RTS6 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
OTOP2Q7RTS6 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
OTOP2Q7RTS6 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
OTOP2Q7RTS6 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
OTOP2Q7RTS6 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
OTOP2Q7RTS6 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
OTOP2Q7RTS6 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
OTOP2Q7RTS6 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
OTOP2Q7RTS6 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
OTOP2Q7RTS6 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
OTOP2Q7RTS6 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
OTOP2Q7RTS6 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
OTOP2Q7RTS6 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
OTOP2Q7RTS6 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
OTOP2Q7RTS6 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
OTOP2Q7RTS6 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
OTOP2Q7RTS6 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
OTOP2Q7RTS6 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
OTOP2Q7RTS6 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
OTOP2Q7RTS6 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
OTOP2Q7RTS6 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
OTOP2Q7RTS6 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
OTOP2Q7RTS6 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
OTOP2Q7RTS6 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
OTOP2Q7RTS6 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
OTOP2Q7RTS6 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
OTOP2Q7RTS6 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
OTOP2Q7RTS6 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
OTOP2Q7RTS6 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
OTOP2Q7RTS6 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
OTOP2Q7RTS6 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
OTOP2Q7RTS6 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
OTOP2Q7RTS6 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
OTOP2Q7RTS6 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
OTOP2Q7RTS6 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
OTOP2Q7RTS6 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
OTOP2Q7RTS6 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
OTOP2Q7RTS6 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
OTOP2Q7RTS6 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
OTOP2Q7RTS6 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
OTOP2Q7RTS6 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
OTOP2Q7RTS6 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
OTOP2Q7RTS6 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
OTOP2Q7RTS6 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
OTOP2Q7RTS6 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
OTOP2Q7RTS6 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
OTOP2Q7RTS6 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
OTOP2Q7RTS6 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
OTOP2Q7RTS6 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
OTOP2Q7RTS6 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
OTOP2Q7RTS6 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
OTOP2Q7RTS6 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
OTOP2Q7RTS6 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
OTOP2Q7RTS6 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
OTOP2Q7RTS6 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
OTOP2Q7RTS6 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
OTOP2Q7RTS6 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
OTOP2Q7RTS6 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
OTOP2Q7RTS6 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
OTOP2Q7RTS6 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
OTOP2Q7RTS6 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
OTOP2Q7RTS6 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
OTOP2Q7RTS6 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
OTOP2Q7RTS6 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
OTOP2Q7RTS6 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
OTOP2Q7RTS6 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
OTOP2Q7RTS6 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
OTOP2Q7RTS6 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
OTOP2Q7RTS6 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
OTOP2Q7RTS6 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
OTOP2Q7RTS6 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
OTOP2Q7RTS6 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
OTOP2Q7RTS6 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
OTOP2Q7RTS6 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
OTOP2Q7RTS6 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
OTOP2Q7RTS6 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
OTOP2Q7RTS6 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
OTOP2Q7RTS6 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
OTOP2Q7RTS6 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
OTOP2Q7RTS6 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
OTOP2Q7RTS6 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
OTOP2Q7RTS6 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
OTOP2Q7RTS6 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
OTOP2Q7RTS6 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
OTOP2Q7RTS6 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
OTOP2Q7RTS6 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
OTOP2Q7RTS6 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
OTOP2Q7RTS6 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
OTOP2Q7RTS6 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
OTOP2Q7RTS6 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
OTOP2Q7RTS6 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
OTOP2Q7RTS6 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
OTOP2Q7RTS6 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
OTOP2Q7RTS6 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
OTOP2Q7RTS6 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms