Protein–RNA interactions for Protein: Q719H9

KCTD1, BTB/POZ domain-containing protein KCTD1, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCTD1Q719H9 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
KCTD1Q719H9 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
KCTD1Q719H9 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
KCTD1Q719H9 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
KCTD1Q719H9 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
KCTD1Q719H9 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
KCTD1Q719H9 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
KCTD1Q719H9 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
KCTD1Q719H9 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
KCTD1Q719H9 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
KCTD1Q719H9 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
KCTD1Q719H9 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
KCTD1Q719H9 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
KCTD1Q719H9 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
KCTD1Q719H9 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
KCTD1Q719H9 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
KCTD1Q719H9 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
KCTD1Q719H9 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
KCTD1Q719H9 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
KCTD1Q719H9 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
KCTD1Q719H9 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
KCTD1Q719H9 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
KCTD1Q719H9 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
KCTD1Q719H9 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
KCTD1Q719H9 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
KCTD1Q719H9 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
KCTD1Q719H9 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
KCTD1Q719H9 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
KCTD1Q719H9 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
KCTD1Q719H9 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
KCTD1Q719H9 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
KCTD1Q719H9 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
KCTD1Q719H9 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
KCTD1Q719H9 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
KCTD1Q719H9 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC27.13■■□□□ 1.93
KCTD1Q719H9 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
KCTD1Q719H9 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
KCTD1Q719H9 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
KCTD1Q719H9 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
KCTD1Q719H9 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
KCTD1Q719H9 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
KCTD1Q719H9 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
KCTD1Q719H9 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
KCTD1Q719H9 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
KCTD1Q719H9 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
KCTD1Q719H9 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
KCTD1Q719H9 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
KCTD1Q719H9 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
KCTD1Q719H9 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
KCTD1Q719H9 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
KCTD1Q719H9 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
KCTD1Q719H9 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
KCTD1Q719H9 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
KCTD1Q719H9 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
KCTD1Q719H9 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
KCTD1Q719H9 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
KCTD1Q719H9 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
KCTD1Q719H9 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
KCTD1Q719H9 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
KCTD1Q719H9 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC27.09■■□□□ 1.93
KCTD1Q719H9 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
KCTD1Q719H9 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
KCTD1Q719H9 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
KCTD1Q719H9 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC27.08■■□□□ 1.93
KCTD1Q719H9 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
KCTD1Q719H9 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
KCTD1Q719H9 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
KCTD1Q719H9 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
KCTD1Q719H9 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
KCTD1Q719H9 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
KCTD1Q719H9 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
KCTD1Q719H9 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
KCTD1Q719H9 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
KCTD1Q719H9 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
KCTD1Q719H9 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
KCTD1Q719H9 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
KCTD1Q719H9 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
KCTD1Q719H9 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
KCTD1Q719H9 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
KCTD1Q719H9 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
KCTD1Q719H9 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
KCTD1Q719H9 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
KCTD1Q719H9 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
KCTD1Q719H9 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
KCTD1Q719H9 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
KCTD1Q719H9 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
KCTD1Q719H9 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
KCTD1Q719H9 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
KCTD1Q719H9 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
KCTD1Q719H9 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
KCTD1Q719H9 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
KCTD1Q719H9 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
KCTD1Q719H9 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
KCTD1Q719H9 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
KCTD1Q719H9 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
KCTD1Q719H9 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
KCTD1Q719H9 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
KCTD1Q719H9 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
KCTD1Q719H9 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
KCTD1Q719H9 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms