Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZV65

FAM47E, Protein FAM47E, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM47EQ6ZV65 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FAM47EQ6ZV65 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FAM47EQ6ZV65 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FAM47EQ6ZV65 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FAM47EQ6ZV65 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FAM47EQ6ZV65 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FAM47EQ6ZV65 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FAM47EQ6ZV65 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FAM47EQ6ZV65 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FAM47EQ6ZV65 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FAM47EQ6ZV65 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FAM47EQ6ZV65 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FAM47EQ6ZV65 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FAM47EQ6ZV65 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FAM47EQ6ZV65 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FAM47EQ6ZV65 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FAM47EQ6ZV65 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FAM47EQ6ZV65 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FAM47EQ6ZV65 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FAM47EQ6ZV65 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FAM47EQ6ZV65 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FAM47EQ6ZV65 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FAM47EQ6ZV65 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FAM47EQ6ZV65 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FAM47EQ6ZV65 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
FAM47EQ6ZV65 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FAM47EQ6ZV65 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FAM47EQ6ZV65 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FAM47EQ6ZV65 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FAM47EQ6ZV65 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FAM47EQ6ZV65 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FAM47EQ6ZV65 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FAM47EQ6ZV65 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FAM47EQ6ZV65 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FAM47EQ6ZV65 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FAM47EQ6ZV65 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FAM47EQ6ZV65 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FAM47EQ6ZV65 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FAM47EQ6ZV65 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FAM47EQ6ZV65 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FAM47EQ6ZV65 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FAM47EQ6ZV65 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FAM47EQ6ZV65 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FAM47EQ6ZV65 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FAM47EQ6ZV65 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FAM47EQ6ZV65 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FAM47EQ6ZV65 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
FAM47EQ6ZV65 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FAM47EQ6ZV65 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FAM47EQ6ZV65 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FAM47EQ6ZV65 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FAM47EQ6ZV65 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FAM47EQ6ZV65 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
FAM47EQ6ZV65 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FAM47EQ6ZV65 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FAM47EQ6ZV65 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FAM47EQ6ZV65 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FAM47EQ6ZV65 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FAM47EQ6ZV65 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FAM47EQ6ZV65 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FAM47EQ6ZV65 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FAM47EQ6ZV65 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
FAM47EQ6ZV65 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FAM47EQ6ZV65 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FAM47EQ6ZV65 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FAM47EQ6ZV65 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FAM47EQ6ZV65 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FAM47EQ6ZV65 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FAM47EQ6ZV65 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FAM47EQ6ZV65 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FAM47EQ6ZV65 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FAM47EQ6ZV65 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FAM47EQ6ZV65 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FAM47EQ6ZV65 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FAM47EQ6ZV65 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FAM47EQ6ZV65 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FAM47EQ6ZV65 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FAM47EQ6ZV65 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FAM47EQ6ZV65 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FAM47EQ6ZV65 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FAM47EQ6ZV65 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FAM47EQ6ZV65 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FAM47EQ6ZV65 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FAM47EQ6ZV65 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FAM47EQ6ZV65 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FAM47EQ6ZV65 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FAM47EQ6ZV65 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FAM47EQ6ZV65 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FAM47EQ6ZV65 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FAM47EQ6ZV65 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FAM47EQ6ZV65 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FAM47EQ6ZV65 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FAM47EQ6ZV65 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FAM47EQ6ZV65 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FAM47EQ6ZV65 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FAM47EQ6ZV65 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FAM47EQ6ZV65 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FAM47EQ6ZV65 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FAM47EQ6ZV65 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FAM47EQ6ZV65 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms