Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRR5

TMEM136, Transmembrane protein 136, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM136Q6ZRR5 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TMEM136Q6ZRR5 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
TMEM136Q6ZRR5 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TMEM136Q6ZRR5 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TMEM136Q6ZRR5 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TMEM136Q6ZRR5 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TMEM136Q6ZRR5 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TMEM136Q6ZRR5 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TMEM136Q6ZRR5 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TMEM136Q6ZRR5 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TMEM136Q6ZRR5 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TMEM136Q6ZRR5 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TMEM136Q6ZRR5 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TMEM136Q6ZRR5 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TMEM136Q6ZRR5 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TMEM136Q6ZRR5 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TMEM136Q6ZRR5 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TMEM136Q6ZRR5 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TMEM136Q6ZRR5 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TMEM136Q6ZRR5 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TMEM136Q6ZRR5 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TMEM136Q6ZRR5 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TMEM136Q6ZRR5 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TMEM136Q6ZRR5 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TMEM136Q6ZRR5 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
TMEM136Q6ZRR5 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TMEM136Q6ZRR5 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TMEM136Q6ZRR5 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TMEM136Q6ZRR5 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TMEM136Q6ZRR5 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TMEM136Q6ZRR5 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TMEM136Q6ZRR5 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TMEM136Q6ZRR5 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TMEM136Q6ZRR5 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TMEM136Q6ZRR5 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TMEM136Q6ZRR5 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TMEM136Q6ZRR5 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TMEM136Q6ZRR5 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TMEM136Q6ZRR5 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMEM136Q6ZRR5 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
TMEM136Q6ZRR5 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMEM136Q6ZRR5 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMEM136Q6ZRR5 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMEM136Q6ZRR5 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMEM136Q6ZRR5 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMEM136Q6ZRR5 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMEM136Q6ZRR5 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMEM136Q6ZRR5 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMEM136Q6ZRR5 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMEM136Q6ZRR5 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMEM136Q6ZRR5 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMEM136Q6ZRR5 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMEM136Q6ZRR5 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMEM136Q6ZRR5 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMEM136Q6ZRR5 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMEM136Q6ZRR5 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMEM136Q6ZRR5 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMEM136Q6ZRR5 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
TMEM136Q6ZRR5 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMEM136Q6ZRR5 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMEM136Q6ZRR5 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMEM136Q6ZRR5 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMEM136Q6ZRR5 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMEM136Q6ZRR5 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMEM136Q6ZRR5 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMEM136Q6ZRR5 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMEM136Q6ZRR5 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMEM136Q6ZRR5 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMEM136Q6ZRR5 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMEM136Q6ZRR5 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMEM136Q6ZRR5 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMEM136Q6ZRR5 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
TMEM136Q6ZRR5 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
TMEM136Q6ZRR5 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMEM136Q6ZRR5 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMEM136Q6ZRR5 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMEM136Q6ZRR5 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMEM136Q6ZRR5 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMEM136Q6ZRR5 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMEM136Q6ZRR5 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMEM136Q6ZRR5 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMEM136Q6ZRR5 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMEM136Q6ZRR5 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TMEM136Q6ZRR5 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TMEM136Q6ZRR5 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TMEM136Q6ZRR5 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
TMEM136Q6ZRR5 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TMEM136Q6ZRR5 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TMEM136Q6ZRR5 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TMEM136Q6ZRR5 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TMEM136Q6ZRR5 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TMEM136Q6ZRR5 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TMEM136Q6ZRR5 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TMEM136Q6ZRR5 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
TMEM136Q6ZRR5 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
TMEM136Q6ZRR5 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TMEM136Q6ZRR5 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TMEM136Q6ZRR5 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TMEM136Q6ZRR5 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TMEM136Q6ZRR5 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms