Protein–RNA interactions for Protein: Q6YHK3

CD109, CD109 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 1,445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD109Q6YHK3 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
CD109Q6YHK3 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC36.25■■■■□ 3.39
CD109Q6YHK3 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
CD109Q6YHK3 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC36.25■■■■□ 3.39
CD109Q6YHK3 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.25■■■■□ 3.39
CD109Q6YHK3 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
CD109Q6YHK3 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
CD109Q6YHK3 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC36.24■■■■□ 3.39
CD109Q6YHK3 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
CD109Q6YHK3 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC36.24■■■■□ 3.39
CD109Q6YHK3 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
CD109Q6YHK3 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
CD109Q6YHK3 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
CD109Q6YHK3 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.24■■■■□ 3.39
CD109Q6YHK3 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
CD109Q6YHK3 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.23■■■■□ 3.39
CD109Q6YHK3 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.23■■■■□ 3.39
CD109Q6YHK3 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC36.23■■■■□ 3.39
CD109Q6YHK3 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
CD109Q6YHK3 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC36.23■■■■□ 3.39
CD109Q6YHK3 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
CD109Q6YHK3 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
CD109Q6YHK3 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC36.22■■■■□ 3.39
CD109Q6YHK3 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC36.22■■■■□ 3.39
CD109Q6YHK3 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC36.22■■■■□ 3.39
CD109Q6YHK3 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
CD109Q6YHK3 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.21■■■■□ 3.39
CD109Q6YHK3 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
CD109Q6YHK3 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC36.21■■■■□ 3.39
CD109Q6YHK3 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.21■■■■□ 3.39
CD109Q6YHK3 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC36.21■■■■□ 3.39
CD109Q6YHK3 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC36.21■■■■□ 3.39
CD109Q6YHK3 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.21■■■■□ 3.39
CD109Q6YHK3 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC36.2■■■■□ 3.39
CD109Q6YHK3 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
CD109Q6YHK3 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC36.2■■■■□ 3.39
CD109Q6YHK3 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
CD109Q6YHK3 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC36.2■■■■□ 3.39
CD109Q6YHK3 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC36.2■■■■□ 3.39
CD109Q6YHK3 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
CD109Q6YHK3 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.19■■■■□ 3.38
CD109Q6YHK3 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
CD109Q6YHK3 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
CD109Q6YHK3 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC36.17■■■■□ 3.38
CD109Q6YHK3 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC36.17■■■■□ 3.38
CD109Q6YHK3 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC36.17■■■■□ 3.38
CD109Q6YHK3 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
CD109Q6YHK3 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC36.17■■■■□ 3.38
CD109Q6YHK3 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
CD109Q6YHK3 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
CD109Q6YHK3 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
CD109Q6YHK3 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
CD109Q6YHK3 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC36.17■■■■□ 3.38
CD109Q6YHK3 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.16■■■■□ 3.38
CD109Q6YHK3 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC36.16■■■■□ 3.38
CD109Q6YHK3 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.16■■■■□ 3.38
CD109Q6YHK3 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
CD109Q6YHK3 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC36.16■■■■□ 3.38
CD109Q6YHK3 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC36.16■■■■□ 3.38
CD109Q6YHK3 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC36.16■■■■□ 3.38
CD109Q6YHK3 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC36.16■■■■□ 3.38
CD109Q6YHK3 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC36.15■■■■□ 3.38
CD109Q6YHK3 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
CD109Q6YHK3 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC36.15■■■■□ 3.38
CD109Q6YHK3 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC36.15■■■■□ 3.38
CD109Q6YHK3 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC36.15■■■■□ 3.38
CD109Q6YHK3 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC36.15■■■■□ 3.38
CD109Q6YHK3 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.14■■■■□ 3.38
CD109Q6YHK3 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC36.14■■■■□ 3.38
CD109Q6YHK3 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
CD109Q6YHK3 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC36.14■■■■□ 3.38
CD109Q6YHK3 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC36.14■■■■□ 3.38
CD109Q6YHK3 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC36.14■■■■□ 3.38
CD109Q6YHK3 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC36.14■■■■□ 3.38
CD109Q6YHK3 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC36.13■■■■□ 3.37
CD109Q6YHK3 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC36.13■■■■□ 3.37
CD109Q6YHK3 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC36.13■■■■□ 3.37
CD109Q6YHK3 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC36.13■■■■□ 3.37
CD109Q6YHK3 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC36.13■■■■□ 3.37
CD109Q6YHK3 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC36.13■■■■□ 3.37
CD109Q6YHK3 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC36.13■■■■□ 3.37
CD109Q6YHK3 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC36.11■■■■□ 3.37
CD109Q6YHK3 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
CD109Q6YHK3 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC36.1■■■■□ 3.37
CD109Q6YHK3 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC36.1■■■■□ 3.37
CD109Q6YHK3 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC36.1■■■■□ 3.37
CD109Q6YHK3 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
CD109Q6YHK3 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC36.1■■■■□ 3.37
CD109Q6YHK3 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
CD109Q6YHK3 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC36.09■■■■□ 3.37
CD109Q6YHK3 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC36.09■■■■□ 3.37
CD109Q6YHK3 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
CD109Q6YHK3 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC36.09■■■■□ 3.37
CD109Q6YHK3 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
CD109Q6YHK3 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC36.08■■■■□ 3.37
CD109Q6YHK3 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC36.08■■■■□ 3.37
CD109Q6YHK3 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC36.08■■■■□ 3.37
CD109Q6YHK3 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC36.08■■■■□ 3.37
CD109Q6YHK3 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC36.08■■■■□ 3.37
CD109Q6YHK3 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms