Protein–RNA interactions for Protein: Q6VY07

PACS1, Phosphofurin acidic cluster sorting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 963 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACS1Q6VY07 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PACS1Q6VY07 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PACS1Q6VY07 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PACS1Q6VY07 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PACS1Q6VY07 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PACS1Q6VY07 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PACS1Q6VY07 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PACS1Q6VY07 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PACS1Q6VY07 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PACS1Q6VY07 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PACS1Q6VY07 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PACS1Q6VY07 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PACS1Q6VY07 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PACS1Q6VY07 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PACS1Q6VY07 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PACS1Q6VY07 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PACS1Q6VY07 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PACS1Q6VY07 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PACS1Q6VY07 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PACS1Q6VY07 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PACS1Q6VY07 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PACS1Q6VY07 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PACS1Q6VY07 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PACS1Q6VY07 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PACS1Q6VY07 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PACS1Q6VY07 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
PACS1Q6VY07 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PACS1Q6VY07 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PACS1Q6VY07 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PACS1Q6VY07 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PACS1Q6VY07 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PACS1Q6VY07 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PACS1Q6VY07 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PACS1Q6VY07 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PACS1Q6VY07 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PACS1Q6VY07 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PACS1Q6VY07 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PACS1Q6VY07 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PACS1Q6VY07 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PACS1Q6VY07 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PACS1Q6VY07 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PACS1Q6VY07 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PACS1Q6VY07 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PACS1Q6VY07 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PACS1Q6VY07 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PACS1Q6VY07 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PACS1Q6VY07 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PACS1Q6VY07 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PACS1Q6VY07 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PACS1Q6VY07 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PACS1Q6VY07 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PACS1Q6VY07 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PACS1Q6VY07 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PACS1Q6VY07 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PACS1Q6VY07 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PACS1Q6VY07 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PACS1Q6VY07 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PACS1Q6VY07 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PACS1Q6VY07 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PACS1Q6VY07 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PACS1Q6VY07 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PACS1Q6VY07 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PACS1Q6VY07 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PACS1Q6VY07 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PACS1Q6VY07 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PACS1Q6VY07 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PACS1Q6VY07 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PACS1Q6VY07 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PACS1Q6VY07 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PACS1Q6VY07 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PACS1Q6VY07 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
PACS1Q6VY07 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
PACS1Q6VY07 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PACS1Q6VY07 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PACS1Q6VY07 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PACS1Q6VY07 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PACS1Q6VY07 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
PACS1Q6VY07 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PACS1Q6VY07 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PACS1Q6VY07 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PACS1Q6VY07 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PACS1Q6VY07 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PACS1Q6VY07 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PACS1Q6VY07 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PACS1Q6VY07 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PACS1Q6VY07 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PACS1Q6VY07 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PACS1Q6VY07 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PACS1Q6VY07 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PACS1Q6VY07 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PACS1Q6VY07 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PACS1Q6VY07 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PACS1Q6VY07 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PACS1Q6VY07 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PACS1Q6VY07 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PACS1Q6VY07 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PACS1Q6VY07 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PACS1Q6VY07 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PACS1Q6VY07 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PACS1Q6VY07 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms