Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWI4

SHISA2, Protein shisa-2 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHISA2Q6UWI4 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SHISA2Q6UWI4 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SHISA2Q6UWI4 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SHISA2Q6UWI4 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SHISA2Q6UWI4 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SHISA2Q6UWI4 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SHISA2Q6UWI4 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SHISA2Q6UWI4 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SHISA2Q6UWI4 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SHISA2Q6UWI4 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SHISA2Q6UWI4 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SHISA2Q6UWI4 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SHISA2Q6UWI4 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SHISA2Q6UWI4 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SHISA2Q6UWI4 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SHISA2Q6UWI4 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SHISA2Q6UWI4 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SHISA2Q6UWI4 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SHISA2Q6UWI4 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SHISA2Q6UWI4 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SHISA2Q6UWI4 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SHISA2Q6UWI4 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SHISA2Q6UWI4 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SHISA2Q6UWI4 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SHISA2Q6UWI4 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SHISA2Q6UWI4 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SHISA2Q6UWI4 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SHISA2Q6UWI4 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SHISA2Q6UWI4 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SHISA2Q6UWI4 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SHISA2Q6UWI4 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SHISA2Q6UWI4 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SHISA2Q6UWI4 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SHISA2Q6UWI4 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SHISA2Q6UWI4 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SHISA2Q6UWI4 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SHISA2Q6UWI4 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SHISA2Q6UWI4 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SHISA2Q6UWI4 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SHISA2Q6UWI4 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SHISA2Q6UWI4 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SHISA2Q6UWI4 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SHISA2Q6UWI4 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SHISA2Q6UWI4 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SHISA2Q6UWI4 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SHISA2Q6UWI4 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SHISA2Q6UWI4 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SHISA2Q6UWI4 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SHISA2Q6UWI4 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SHISA2Q6UWI4 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SHISA2Q6UWI4 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SHISA2Q6UWI4 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SHISA2Q6UWI4 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SHISA2Q6UWI4 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SHISA2Q6UWI4 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
SHISA2Q6UWI4 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SHISA2Q6UWI4 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SHISA2Q6UWI4 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SHISA2Q6UWI4 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SHISA2Q6UWI4 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
SHISA2Q6UWI4 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SHISA2Q6UWI4 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SHISA2Q6UWI4 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SHISA2Q6UWI4 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SHISA2Q6UWI4 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SHISA2Q6UWI4 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SHISA2Q6UWI4 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SHISA2Q6UWI4 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SHISA2Q6UWI4 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SHISA2Q6UWI4 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SHISA2Q6UWI4 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SHISA2Q6UWI4 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SHISA2Q6UWI4 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SHISA2Q6UWI4 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
SHISA2Q6UWI4 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SHISA2Q6UWI4 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SHISA2Q6UWI4 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
SHISA2Q6UWI4 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
SHISA2Q6UWI4 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SHISA2Q6UWI4 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SHISA2Q6UWI4 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SHISA2Q6UWI4 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SHISA2Q6UWI4 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SHISA2Q6UWI4 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SHISA2Q6UWI4 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SHISA2Q6UWI4 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SHISA2Q6UWI4 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SHISA2Q6UWI4 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SHISA2Q6UWI4 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SHISA2Q6UWI4 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SHISA2Q6UWI4 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SHISA2Q6UWI4 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SHISA2Q6UWI4 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SHISA2Q6UWI4 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SHISA2Q6UWI4 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SHISA2Q6UWI4 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SHISA2Q6UWI4 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SHISA2Q6UWI4 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SHISA2Q6UWI4 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SHISA2Q6UWI4 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms