Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q0C0

TRAF7, E3 ubiquitin-protein ligase TRAF7, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF7Q6Q0C0 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TRAF7Q6Q0C0 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
TRAF7Q6Q0C0 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRAF7Q6Q0C0 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRAF7Q6Q0C0 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRAF7Q6Q0C0 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRAF7Q6Q0C0 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRAF7Q6Q0C0 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRAF7Q6Q0C0 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRAF7Q6Q0C0 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRAF7Q6Q0C0 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRAF7Q6Q0C0 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRAF7Q6Q0C0 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRAF7Q6Q0C0 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRAF7Q6Q0C0 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
TRAF7Q6Q0C0 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRAF7Q6Q0C0 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TRAF7Q6Q0C0 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TRAF7Q6Q0C0 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TRAF7Q6Q0C0 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TRAF7Q6Q0C0 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TRAF7Q6Q0C0 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
TRAF7Q6Q0C0 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TRAF7Q6Q0C0 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TRAF7Q6Q0C0 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TRAF7Q6Q0C0 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TRAF7Q6Q0C0 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TRAF7Q6Q0C0 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TRAF7Q6Q0C0 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRAF7Q6Q0C0 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRAF7Q6Q0C0 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRAF7Q6Q0C0 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRAF7Q6Q0C0 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
TRAF7Q6Q0C0 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRAF7Q6Q0C0 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRAF7Q6Q0C0 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRAF7Q6Q0C0 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRAF7Q6Q0C0 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TRAF7Q6Q0C0 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
TRAF7Q6Q0C0 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TRAF7Q6Q0C0 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TRAF7Q6Q0C0 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
TRAF7Q6Q0C0 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
TRAF7Q6Q0C0 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
TRAF7Q6Q0C0 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRAF7Q6Q0C0 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
TRAF7Q6Q0C0 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRAF7Q6Q0C0 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRAF7Q6Q0C0 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRAF7Q6Q0C0 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRAF7Q6Q0C0 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRAF7Q6Q0C0 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRAF7Q6Q0C0 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRAF7Q6Q0C0 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRAF7Q6Q0C0 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRAF7Q6Q0C0 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRAF7Q6Q0C0 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRAF7Q6Q0C0 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRAF7Q6Q0C0 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRAF7Q6Q0C0 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRAF7Q6Q0C0 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRAF7Q6Q0C0 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRAF7Q6Q0C0 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRAF7Q6Q0C0 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRAF7Q6Q0C0 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRAF7Q6Q0C0 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRAF7Q6Q0C0 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRAF7Q6Q0C0 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRAF7Q6Q0C0 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRAF7Q6Q0C0 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRAF7Q6Q0C0 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRAF7Q6Q0C0 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
TRAF7Q6Q0C0 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRAF7Q6Q0C0 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRAF7Q6Q0C0 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRAF7Q6Q0C0 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRAF7Q6Q0C0 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRAF7Q6Q0C0 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TRAF7Q6Q0C0 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TRAF7Q6Q0C0 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TRAF7Q6Q0C0 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TRAF7Q6Q0C0 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TRAF7Q6Q0C0 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
TRAF7Q6Q0C0 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
TRAF7Q6Q0C0 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TRAF7Q6Q0C0 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
TRAF7Q6Q0C0 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TRAF7Q6Q0C0 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TRAF7Q6Q0C0 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TRAF7Q6Q0C0 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRAF7Q6Q0C0 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRAF7Q6Q0C0 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRAF7Q6Q0C0 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRAF7Q6Q0C0 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRAF7Q6Q0C0 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRAF7Q6Q0C0 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRAF7Q6Q0C0 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRAF7Q6Q0C0 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRAF7Q6Q0C0 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRAF7Q6Q0C0 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms