Protein–RNA interactions for Protein: Q6PI97

C11orf88, UPF0722 protein C11orf88, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C11orf88Q6PI97 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
C11orf88Q6PI97 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
C11orf88Q6PI97 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
C11orf88Q6PI97 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
C11orf88Q6PI97 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
C11orf88Q6PI97 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
C11orf88Q6PI97 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
C11orf88Q6PI97 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
C11orf88Q6PI97 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
C11orf88Q6PI97 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
C11orf88Q6PI97 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
C11orf88Q6PI97 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
C11orf88Q6PI97 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
C11orf88Q6PI97 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
C11orf88Q6PI97 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
C11orf88Q6PI97 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
C11orf88Q6PI97 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
C11orf88Q6PI97 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
C11orf88Q6PI97 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
C11orf88Q6PI97 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
C11orf88Q6PI97 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
C11orf88Q6PI97 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
C11orf88Q6PI97 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
C11orf88Q6PI97 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
C11orf88Q6PI97 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
C11orf88Q6PI97 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
C11orf88Q6PI97 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
C11orf88Q6PI97 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
C11orf88Q6PI97 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
C11orf88Q6PI97 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
C11orf88Q6PI97 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
C11orf88Q6PI97 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
C11orf88Q6PI97 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
C11orf88Q6PI97 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
C11orf88Q6PI97 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
C11orf88Q6PI97 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
C11orf88Q6PI97 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
C11orf88Q6PI97 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
C11orf88Q6PI97 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
C11orf88Q6PI97 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
C11orf88Q6PI97 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
C11orf88Q6PI97 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
C11orf88Q6PI97 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
C11orf88Q6PI97 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
C11orf88Q6PI97 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
C11orf88Q6PI97 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
C11orf88Q6PI97 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
C11orf88Q6PI97 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
C11orf88Q6PI97 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
C11orf88Q6PI97 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
C11orf88Q6PI97 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
C11orf88Q6PI97 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
C11orf88Q6PI97 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
C11orf88Q6PI97 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
C11orf88Q6PI97 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
C11orf88Q6PI97 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
C11orf88Q6PI97 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
C11orf88Q6PI97 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
C11orf88Q6PI97 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
C11orf88Q6PI97 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
C11orf88Q6PI97 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
C11orf88Q6PI97 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
C11orf88Q6PI97 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
C11orf88Q6PI97 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
C11orf88Q6PI97 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
C11orf88Q6PI97 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
C11orf88Q6PI97 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
C11orf88Q6PI97 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
C11orf88Q6PI97 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
C11orf88Q6PI97 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
C11orf88Q6PI97 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
C11orf88Q6PI97 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
C11orf88Q6PI97 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
C11orf88Q6PI97 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
C11orf88Q6PI97 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
C11orf88Q6PI97 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
C11orf88Q6PI97 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
C11orf88Q6PI97 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
C11orf88Q6PI97 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
C11orf88Q6PI97 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
C11orf88Q6PI97 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
C11orf88Q6PI97 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
C11orf88Q6PI97 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
C11orf88Q6PI97 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
C11orf88Q6PI97 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
C11orf88Q6PI97 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
C11orf88Q6PI97 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
C11orf88Q6PI97 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
C11orf88Q6PI97 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
C11orf88Q6PI97 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
C11orf88Q6PI97 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
C11orf88Q6PI97 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
C11orf88Q6PI97 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC20■□□□□ 0.79
C11orf88Q6PI97 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
C11orf88Q6PI97 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
C11orf88Q6PI97 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
C11orf88Q6PI97 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
C11orf88Q6PI97 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
C11orf88Q6PI97 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
C11orf88Q6PI97 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms