Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXT2

H3F3C, Histone H3.3C, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3F3CQ6NXT2 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
H3F3CQ6NXT2 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
H3F3CQ6NXT2 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
H3F3CQ6NXT2 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
H3F3CQ6NXT2 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
H3F3CQ6NXT2 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
H3F3CQ6NXT2 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
H3F3CQ6NXT2 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
H3F3CQ6NXT2 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
H3F3CQ6NXT2 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
H3F3CQ6NXT2 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
H3F3CQ6NXT2 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
H3F3CQ6NXT2 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
H3F3CQ6NXT2 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
H3F3CQ6NXT2 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
H3F3CQ6NXT2 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
H3F3CQ6NXT2 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
H3F3CQ6NXT2 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
H3F3CQ6NXT2 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
H3F3CQ6NXT2 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
H3F3CQ6NXT2 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
H3F3CQ6NXT2 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
H3F3CQ6NXT2 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
H3F3CQ6NXT2 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
H3F3CQ6NXT2 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
H3F3CQ6NXT2 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
H3F3CQ6NXT2 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
H3F3CQ6NXT2 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
H3F3CQ6NXT2 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
H3F3CQ6NXT2 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
H3F3CQ6NXT2 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
H3F3CQ6NXT2 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
H3F3CQ6NXT2 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
H3F3CQ6NXT2 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
H3F3CQ6NXT2 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
H3F3CQ6NXT2 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
H3F3CQ6NXT2 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
H3F3CQ6NXT2 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
H3F3CQ6NXT2 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
H3F3CQ6NXT2 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
H3F3CQ6NXT2 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
H3F3CQ6NXT2 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
H3F3CQ6NXT2 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
H3F3CQ6NXT2 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
H3F3CQ6NXT2 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
H3F3CQ6NXT2 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
H3F3CQ6NXT2 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
H3F3CQ6NXT2 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
H3F3CQ6NXT2 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
H3F3CQ6NXT2 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
H3F3CQ6NXT2 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
H3F3CQ6NXT2 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
H3F3CQ6NXT2 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
H3F3CQ6NXT2 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
H3F3CQ6NXT2 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
H3F3CQ6NXT2 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
H3F3CQ6NXT2 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
H3F3CQ6NXT2 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
H3F3CQ6NXT2 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
H3F3CQ6NXT2 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
H3F3CQ6NXT2 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
H3F3CQ6NXT2 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
H3F3CQ6NXT2 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
H3F3CQ6NXT2 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
H3F3CQ6NXT2 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
H3F3CQ6NXT2 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
H3F3CQ6NXT2 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
H3F3CQ6NXT2 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
H3F3CQ6NXT2 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
H3F3CQ6NXT2 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
H3F3CQ6NXT2 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
H3F3CQ6NXT2 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
H3F3CQ6NXT2 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
H3F3CQ6NXT2 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
H3F3CQ6NXT2 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
H3F3CQ6NXT2 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
H3F3CQ6NXT2 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
H3F3CQ6NXT2 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
H3F3CQ6NXT2 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
H3F3CQ6NXT2 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
H3F3CQ6NXT2 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
H3F3CQ6NXT2 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
H3F3CQ6NXT2 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
H3F3CQ6NXT2 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
H3F3CQ6NXT2 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
H3F3CQ6NXT2 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
H3F3CQ6NXT2 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
H3F3CQ6NXT2 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
H3F3CQ6NXT2 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
H3F3CQ6NXT2 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
H3F3CQ6NXT2 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
H3F3CQ6NXT2 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
H3F3CQ6NXT2 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
H3F3CQ6NXT2 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
H3F3CQ6NXT2 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
H3F3CQ6NXT2 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
H3F3CQ6NXT2 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
H3F3CQ6NXT2 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
H3F3CQ6NXT2 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
H3F3CQ6NXT2 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms