Protein–RNA interactions for Protein: Q6NT76

HMBOX1, Homeobox-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMBOX1Q6NT76 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HMBOX1Q6NT76 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HMBOX1Q6NT76 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HMBOX1Q6NT76 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HMBOX1Q6NT76 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HMBOX1Q6NT76 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HMBOX1Q6NT76 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HMBOX1Q6NT76 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HMBOX1Q6NT76 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HMBOX1Q6NT76 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HMBOX1Q6NT76 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HMBOX1Q6NT76 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HMBOX1Q6NT76 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HMBOX1Q6NT76 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HMBOX1Q6NT76 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HMBOX1Q6NT76 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HMBOX1Q6NT76 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
HMBOX1Q6NT76 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HMBOX1Q6NT76 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HMBOX1Q6NT76 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HMBOX1Q6NT76 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HMBOX1Q6NT76 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HMBOX1Q6NT76 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HMBOX1Q6NT76 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HMBOX1Q6NT76 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HMBOX1Q6NT76 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HMBOX1Q6NT76 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HMBOX1Q6NT76 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HMBOX1Q6NT76 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HMBOX1Q6NT76 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HMBOX1Q6NT76 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HMBOX1Q6NT76 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HMBOX1Q6NT76 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HMBOX1Q6NT76 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HMBOX1Q6NT76 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
HMBOX1Q6NT76 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
HMBOX1Q6NT76 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HMBOX1Q6NT76 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HMBOX1Q6NT76 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HMBOX1Q6NT76 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HMBOX1Q6NT76 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HMBOX1Q6NT76 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HMBOX1Q6NT76 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HMBOX1Q6NT76 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HMBOX1Q6NT76 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HMBOX1Q6NT76 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HMBOX1Q6NT76 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HMBOX1Q6NT76 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HMBOX1Q6NT76 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HMBOX1Q6NT76 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HMBOX1Q6NT76 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HMBOX1Q6NT76 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HMBOX1Q6NT76 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HMBOX1Q6NT76 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
HMBOX1Q6NT76 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
HMBOX1Q6NT76 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HMBOX1Q6NT76 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HMBOX1Q6NT76 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HMBOX1Q6NT76 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HMBOX1Q6NT76 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HMBOX1Q6NT76 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HMBOX1Q6NT76 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HMBOX1Q6NT76 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
HMBOX1Q6NT76 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
HMBOX1Q6NT76 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HMBOX1Q6NT76 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HMBOX1Q6NT76 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HMBOX1Q6NT76 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HMBOX1Q6NT76 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HMBOX1Q6NT76 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HMBOX1Q6NT76 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
HMBOX1Q6NT76 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HMBOX1Q6NT76 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HMBOX1Q6NT76 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HMBOX1Q6NT76 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HMBOX1Q6NT76 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HMBOX1Q6NT76 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HMBOX1Q6NT76 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HMBOX1Q6NT76 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HMBOX1Q6NT76 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HMBOX1Q6NT76 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HMBOX1Q6NT76 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HMBOX1Q6NT76 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HMBOX1Q6NT76 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HMBOX1Q6NT76 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HMBOX1Q6NT76 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HMBOX1Q6NT76 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HMBOX1Q6NT76 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HMBOX1Q6NT76 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HMBOX1Q6NT76 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HMBOX1Q6NT76 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HMBOX1Q6NT76 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HMBOX1Q6NT76 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HMBOX1Q6NT76 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HMBOX1Q6NT76 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HMBOX1Q6NT76 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HMBOX1Q6NT76 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HMBOX1Q6NT76 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HMBOX1Q6NT76 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HMBOX1Q6NT76 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms