Protein–RNA interactions for Protein: Q6MZZ7

CAPN13, Calpain-13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN13Q6MZZ7 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CAPN13Q6MZZ7 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CAPN13Q6MZZ7 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CAPN13Q6MZZ7 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CAPN13Q6MZZ7 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CAPN13Q6MZZ7 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CAPN13Q6MZZ7 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CAPN13Q6MZZ7 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CAPN13Q6MZZ7 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CAPN13Q6MZZ7 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CAPN13Q6MZZ7 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CAPN13Q6MZZ7 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CAPN13Q6MZZ7 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CAPN13Q6MZZ7 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CAPN13Q6MZZ7 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CAPN13Q6MZZ7 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CAPN13Q6MZZ7 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CAPN13Q6MZZ7 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CAPN13Q6MZZ7 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CAPN13Q6MZZ7 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CAPN13Q6MZZ7 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CAPN13Q6MZZ7 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CAPN13Q6MZZ7 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CAPN13Q6MZZ7 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CAPN13Q6MZZ7 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CAPN13Q6MZZ7 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CAPN13Q6MZZ7 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CAPN13Q6MZZ7 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CAPN13Q6MZZ7 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CAPN13Q6MZZ7 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CAPN13Q6MZZ7 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CAPN13Q6MZZ7 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CAPN13Q6MZZ7 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CAPN13Q6MZZ7 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CAPN13Q6MZZ7 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CAPN13Q6MZZ7 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CAPN13Q6MZZ7 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CAPN13Q6MZZ7 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CAPN13Q6MZZ7 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CAPN13Q6MZZ7 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CAPN13Q6MZZ7 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CAPN13Q6MZZ7 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CAPN13Q6MZZ7 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CAPN13Q6MZZ7 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CAPN13Q6MZZ7 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CAPN13Q6MZZ7 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CAPN13Q6MZZ7 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CAPN13Q6MZZ7 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CAPN13Q6MZZ7 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CAPN13Q6MZZ7 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CAPN13Q6MZZ7 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CAPN13Q6MZZ7 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CAPN13Q6MZZ7 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CAPN13Q6MZZ7 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CAPN13Q6MZZ7 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CAPN13Q6MZZ7 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CAPN13Q6MZZ7 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CAPN13Q6MZZ7 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CAPN13Q6MZZ7 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CAPN13Q6MZZ7 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CAPN13Q6MZZ7 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CAPN13Q6MZZ7 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CAPN13Q6MZZ7 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CAPN13Q6MZZ7 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CAPN13Q6MZZ7 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CAPN13Q6MZZ7 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CAPN13Q6MZZ7 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CAPN13Q6MZZ7 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CAPN13Q6MZZ7 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CAPN13Q6MZZ7 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CAPN13Q6MZZ7 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CAPN13Q6MZZ7 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CAPN13Q6MZZ7 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CAPN13Q6MZZ7 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CAPN13Q6MZZ7 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CAPN13Q6MZZ7 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CAPN13Q6MZZ7 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CAPN13Q6MZZ7 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CAPN13Q6MZZ7 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CAPN13Q6MZZ7 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CAPN13Q6MZZ7 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CAPN13Q6MZZ7 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CAPN13Q6MZZ7 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CAPN13Q6MZZ7 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CAPN13Q6MZZ7 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CAPN13Q6MZZ7 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CAPN13Q6MZZ7 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CAPN13Q6MZZ7 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CAPN13Q6MZZ7 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CAPN13Q6MZZ7 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CAPN13Q6MZZ7 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CAPN13Q6MZZ7 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CAPN13Q6MZZ7 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CAPN13Q6MZZ7 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CAPN13Q6MZZ7 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CAPN13Q6MZZ7 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CAPN13Q6MZZ7 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CAPN13Q6MZZ7 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CAPN13Q6MZZ7 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CAPN13Q6MZZ7 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms