Protein–RNA interactions for Protein: Q6JVE5

LCN12, Epididymal-specific lipocalin-12, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCN12Q6JVE5 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LCN12Q6JVE5 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LCN12Q6JVE5 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LCN12Q6JVE5 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
LCN12Q6JVE5 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
LCN12Q6JVE5 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
LCN12Q6JVE5 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LCN12Q6JVE5 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LCN12Q6JVE5 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LCN12Q6JVE5 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LCN12Q6JVE5 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LCN12Q6JVE5 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LCN12Q6JVE5 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LCN12Q6JVE5 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LCN12Q6JVE5 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LCN12Q6JVE5 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LCN12Q6JVE5 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LCN12Q6JVE5 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LCN12Q6JVE5 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LCN12Q6JVE5 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LCN12Q6JVE5 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LCN12Q6JVE5 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
LCN12Q6JVE5 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LCN12Q6JVE5 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LCN12Q6JVE5 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
LCN12Q6JVE5 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LCN12Q6JVE5 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
LCN12Q6JVE5 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LCN12Q6JVE5 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LCN12Q6JVE5 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LCN12Q6JVE5 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LCN12Q6JVE5 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
LCN12Q6JVE5 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LCN12Q6JVE5 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LCN12Q6JVE5 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
LCN12Q6JVE5 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LCN12Q6JVE5 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LCN12Q6JVE5 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LCN12Q6JVE5 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LCN12Q6JVE5 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LCN12Q6JVE5 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LCN12Q6JVE5 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LCN12Q6JVE5 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LCN12Q6JVE5 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LCN12Q6JVE5 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LCN12Q6JVE5 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LCN12Q6JVE5 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LCN12Q6JVE5 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LCN12Q6JVE5 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LCN12Q6JVE5 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LCN12Q6JVE5 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
LCN12Q6JVE5 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LCN12Q6JVE5 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LCN12Q6JVE5 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LCN12Q6JVE5 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LCN12Q6JVE5 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LCN12Q6JVE5 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LCN12Q6JVE5 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LCN12Q6JVE5 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LCN12Q6JVE5 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LCN12Q6JVE5 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LCN12Q6JVE5 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LCN12Q6JVE5 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LCN12Q6JVE5 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LCN12Q6JVE5 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
LCN12Q6JVE5 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LCN12Q6JVE5 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LCN12Q6JVE5 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LCN12Q6JVE5 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LCN12Q6JVE5 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LCN12Q6JVE5 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LCN12Q6JVE5 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LCN12Q6JVE5 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LCN12Q6JVE5 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LCN12Q6JVE5 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LCN12Q6JVE5 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LCN12Q6JVE5 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LCN12Q6JVE5 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
LCN12Q6JVE5 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
LCN12Q6JVE5 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
LCN12Q6JVE5 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LCN12Q6JVE5 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LCN12Q6JVE5 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
LCN12Q6JVE5 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LCN12Q6JVE5 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LCN12Q6JVE5 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LCN12Q6JVE5 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LCN12Q6JVE5 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LCN12Q6JVE5 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LCN12Q6JVE5 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LCN12Q6JVE5 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LCN12Q6JVE5 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LCN12Q6JVE5 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
LCN12Q6JVE5 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LCN12Q6JVE5 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
LCN12Q6JVE5 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LCN12Q6JVE5 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LCN12Q6JVE5 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LCN12Q6JVE5 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LCN12Q6JVE5 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms