Protein–RNA interactions for Protein: Q676U5

ATG16L1, Autophagy-related protein 16-1, humanhuman

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L1Q676U5 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATG16L1Q676U5 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATG16L1Q676U5 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATG16L1Q676U5 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATG16L1Q676U5 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATG16L1Q676U5 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATG16L1Q676U5 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
ATG16L1Q676U5 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATG16L1Q676U5 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATG16L1Q676U5 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATG16L1Q676U5 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATG16L1Q676U5 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATG16L1Q676U5 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATG16L1Q676U5 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATG16L1Q676U5 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATG16L1Q676U5 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATG16L1Q676U5 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATG16L1Q676U5 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATG16L1Q676U5 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATG16L1Q676U5 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATG16L1Q676U5 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATG16L1Q676U5 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATG16L1Q676U5 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATG16L1Q676U5 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATG16L1Q676U5 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATG16L1Q676U5 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATG16L1Q676U5 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATG16L1Q676U5 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATG16L1Q676U5 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATG16L1Q676U5 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ATG16L1Q676U5 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ATG16L1Q676U5 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ATG16L1Q676U5 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ATG16L1Q676U5 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ATG16L1Q676U5 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ATG16L1Q676U5 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ATG16L1Q676U5 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ATG16L1Q676U5 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ATG16L1Q676U5 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
ATG16L1Q676U5 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATG16L1Q676U5 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATG16L1Q676U5 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATG16L1Q676U5 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATG16L1Q676U5 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATG16L1Q676U5 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATG16L1Q676U5 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATG16L1Q676U5 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
ATG16L1Q676U5 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATG16L1Q676U5 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATG16L1Q676U5 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATG16L1Q676U5 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATG16L1Q676U5 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATG16L1Q676U5 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATG16L1Q676U5 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATG16L1Q676U5 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATG16L1Q676U5 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
ATG16L1Q676U5 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATG16L1Q676U5 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATG16L1Q676U5 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATG16L1Q676U5 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATG16L1Q676U5 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATG16L1Q676U5 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATG16L1Q676U5 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATG16L1Q676U5 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATG16L1Q676U5 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATG16L1Q676U5 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATG16L1Q676U5 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATG16L1Q676U5 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATG16L1Q676U5 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATG16L1Q676U5 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATG16L1Q676U5 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
ATG16L1Q676U5 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATG16L1Q676U5 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATG16L1Q676U5 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
ATG16L1Q676U5 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
ATG16L1Q676U5 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATG16L1Q676U5 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATG16L1Q676U5 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATG16L1Q676U5 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATG16L1Q676U5 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATG16L1Q676U5 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATG16L1Q676U5 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATG16L1Q676U5 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATG16L1Q676U5 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATG16L1Q676U5 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATG16L1Q676U5 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATG16L1Q676U5 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATG16L1Q676U5 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATG16L1Q676U5 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATG16L1Q676U5 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATG16L1Q676U5 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATG16L1Q676U5 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATG16L1Q676U5 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATG16L1Q676U5 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATG16L1Q676U5 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATG16L1Q676U5 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATG16L1Q676U5 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATG16L1Q676U5 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATG16L1Q676U5 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATG16L1Q676U5 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms