Protein–RNA interactions for Protein: Q5W5X9

TTC23, Tetratricopeptide repeat protein 23, humanhuman

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Length 447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC23Q5W5X9 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TTC23Q5W5X9 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TTC23Q5W5X9 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
TTC23Q5W5X9 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TTC23Q5W5X9 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TTC23Q5W5X9 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TTC23Q5W5X9 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TTC23Q5W5X9 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
TTC23Q5W5X9 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TTC23Q5W5X9 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TTC23Q5W5X9 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TTC23Q5W5X9 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TTC23Q5W5X9 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TTC23Q5W5X9 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TTC23Q5W5X9 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TTC23Q5W5X9 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TTC23Q5W5X9 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TTC23Q5W5X9 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TTC23Q5W5X9 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TTC23Q5W5X9 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TTC23Q5W5X9 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TTC23Q5W5X9 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TTC23Q5W5X9 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TTC23Q5W5X9 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TTC23Q5W5X9 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TTC23Q5W5X9 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TTC23Q5W5X9 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TTC23Q5W5X9 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TTC23Q5W5X9 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TTC23Q5W5X9 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TTC23Q5W5X9 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TTC23Q5W5X9 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TTC23Q5W5X9 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TTC23Q5W5X9 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TTC23Q5W5X9 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TTC23Q5W5X9 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TTC23Q5W5X9 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TTC23Q5W5X9 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
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TTC23Q5W5X9 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
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TTC23Q5W5X9 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TTC23Q5W5X9 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
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TTC23Q5W5X9 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TTC23Q5W5X9 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
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TTC23Q5W5X9 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
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TTC23Q5W5X9 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
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TTC23Q5W5X9 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
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TTC23Q5W5X9 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
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TTC23Q5W5X9 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TTC23Q5W5X9 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TTC23Q5W5X9 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TTC23Q5W5X9 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TTC23Q5W5X9 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TTC23Q5W5X9 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TTC23Q5W5X9 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TTC23Q5W5X9 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TTC23Q5W5X9 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TTC23Q5W5X9 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TTC23Q5W5X9 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TTC23Q5W5X9 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TTC23Q5W5X9 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TTC23Q5W5X9 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TTC23Q5W5X9 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TTC23Q5W5X9 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TTC23Q5W5X9 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TTC23Q5W5X9 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TTC23Q5W5X9 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
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