Protein–RNA interactions for Protein: Q5VYV7

SLX4IP, Protein SLX4IP, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLX4IPQ5VYV7 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLX4IPQ5VYV7 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
SLX4IPQ5VYV7 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLX4IPQ5VYV7 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLX4IPQ5VYV7 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLX4IPQ5VYV7 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLX4IPQ5VYV7 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLX4IPQ5VYV7 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLX4IPQ5VYV7 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLX4IPQ5VYV7 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLX4IPQ5VYV7 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLX4IPQ5VYV7 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLX4IPQ5VYV7 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLX4IPQ5VYV7 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLX4IPQ5VYV7 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLX4IPQ5VYV7 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLX4IPQ5VYV7 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLX4IPQ5VYV7 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
SLX4IPQ5VYV7 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLX4IPQ5VYV7 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLX4IPQ5VYV7 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLX4IPQ5VYV7 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLX4IPQ5VYV7 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLX4IPQ5VYV7 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLX4IPQ5VYV7 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLX4IPQ5VYV7 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLX4IPQ5VYV7 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLX4IPQ5VYV7 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLX4IPQ5VYV7 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLX4IPQ5VYV7 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLX4IPQ5VYV7 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLX4IPQ5VYV7 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLX4IPQ5VYV7 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLX4IPQ5VYV7 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLX4IPQ5VYV7 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLX4IPQ5VYV7 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLX4IPQ5VYV7 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLX4IPQ5VYV7 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLX4IPQ5VYV7 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLX4IPQ5VYV7 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLX4IPQ5VYV7 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLX4IPQ5VYV7 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLX4IPQ5VYV7 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLX4IPQ5VYV7 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLX4IPQ5VYV7 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLX4IPQ5VYV7 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLX4IPQ5VYV7 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLX4IPQ5VYV7 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLX4IPQ5VYV7 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLX4IPQ5VYV7 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLX4IPQ5VYV7 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLX4IPQ5VYV7 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLX4IPQ5VYV7 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SLX4IPQ5VYV7 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SLX4IPQ5VYV7 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
SLX4IPQ5VYV7 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SLX4IPQ5VYV7 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLX4IPQ5VYV7 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLX4IPQ5VYV7 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLX4IPQ5VYV7 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLX4IPQ5VYV7 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLX4IPQ5VYV7 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLX4IPQ5VYV7 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLX4IPQ5VYV7 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLX4IPQ5VYV7 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLX4IPQ5VYV7 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLX4IPQ5VYV7 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLX4IPQ5VYV7 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLX4IPQ5VYV7 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLX4IPQ5VYV7 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLX4IPQ5VYV7 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLX4IPQ5VYV7 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLX4IPQ5VYV7 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLX4IPQ5VYV7 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLX4IPQ5VYV7 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLX4IPQ5VYV7 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLX4IPQ5VYV7 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLX4IPQ5VYV7 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLX4IPQ5VYV7 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLX4IPQ5VYV7 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLX4IPQ5VYV7 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLX4IPQ5VYV7 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLX4IPQ5VYV7 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLX4IPQ5VYV7 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLX4IPQ5VYV7 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLX4IPQ5VYV7 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLX4IPQ5VYV7 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLX4IPQ5VYV7 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLX4IPQ5VYV7 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLX4IPQ5VYV7 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLX4IPQ5VYV7 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLX4IPQ5VYV7 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLX4IPQ5VYV7 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
SLX4IPQ5VYV7 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLX4IPQ5VYV7 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLX4IPQ5VYV7 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLX4IPQ5VYV7 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
SLX4IPQ5VYV7 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLX4IPQ5VYV7 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
SLX4IPQ5VYV7 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms