Protein–RNA interactions for Protein: Q5VV17

OTUD1, OTU domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUD1Q5VV17 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
OTUD1Q5VV17 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
OTUD1Q5VV17 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
OTUD1Q5VV17 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
OTUD1Q5VV17 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
OTUD1Q5VV17 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
OTUD1Q5VV17 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
OTUD1Q5VV17 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
OTUD1Q5VV17 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
OTUD1Q5VV17 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
OTUD1Q5VV17 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
OTUD1Q5VV17 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
OTUD1Q5VV17 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
OTUD1Q5VV17 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
OTUD1Q5VV17 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
OTUD1Q5VV17 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
OTUD1Q5VV17 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
OTUD1Q5VV17 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
OTUD1Q5VV17 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
OTUD1Q5VV17 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
OTUD1Q5VV17 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
OTUD1Q5VV17 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
OTUD1Q5VV17 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
OTUD1Q5VV17 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
OTUD1Q5VV17 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
OTUD1Q5VV17 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
OTUD1Q5VV17 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
OTUD1Q5VV17 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
OTUD1Q5VV17 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
OTUD1Q5VV17 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
OTUD1Q5VV17 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
OTUD1Q5VV17 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
OTUD1Q5VV17 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
OTUD1Q5VV17 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
OTUD1Q5VV17 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
OTUD1Q5VV17 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
OTUD1Q5VV17 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
OTUD1Q5VV17 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
OTUD1Q5VV17 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
OTUD1Q5VV17 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
OTUD1Q5VV17 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
OTUD1Q5VV17 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
OTUD1Q5VV17 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
OTUD1Q5VV17 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
OTUD1Q5VV17 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
OTUD1Q5VV17 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
OTUD1Q5VV17 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
OTUD1Q5VV17 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
OTUD1Q5VV17 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
OTUD1Q5VV17 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
OTUD1Q5VV17 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
OTUD1Q5VV17 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
OTUD1Q5VV17 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
OTUD1Q5VV17 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
OTUD1Q5VV17 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
OTUD1Q5VV17 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
OTUD1Q5VV17 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
OTUD1Q5VV17 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
OTUD1Q5VV17 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
OTUD1Q5VV17 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
OTUD1Q5VV17 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
OTUD1Q5VV17 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
OTUD1Q5VV17 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
OTUD1Q5VV17 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
OTUD1Q5VV17 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
OTUD1Q5VV17 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
OTUD1Q5VV17 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
OTUD1Q5VV17 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
OTUD1Q5VV17 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
OTUD1Q5VV17 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
OTUD1Q5VV17 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
OTUD1Q5VV17 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
OTUD1Q5VV17 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
OTUD1Q5VV17 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
OTUD1Q5VV17 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
OTUD1Q5VV17 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
OTUD1Q5VV17 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
OTUD1Q5VV17 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
OTUD1Q5VV17 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
OTUD1Q5VV17 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
OTUD1Q5VV17 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
OTUD1Q5VV17 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
OTUD1Q5VV17 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
OTUD1Q5VV17 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
OTUD1Q5VV17 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
OTUD1Q5VV17 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
OTUD1Q5VV17 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
OTUD1Q5VV17 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
OTUD1Q5VV17 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
OTUD1Q5VV17 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
OTUD1Q5VV17 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
OTUD1Q5VV17 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
OTUD1Q5VV17 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
OTUD1Q5VV17 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
OTUD1Q5VV17 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
OTUD1Q5VV17 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
OTUD1Q5VV17 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
OTUD1Q5VV17 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
OTUD1Q5VV17 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
OTUD1Q5VV17 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms