Protein–RNA interactions for Protein: Q5VUJ6

LRCH2, Leucine-rich repeat and calponin homology domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRCH2Q5VUJ6 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
LRCH2Q5VUJ6 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
LRCH2Q5VUJ6 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
LRCH2Q5VUJ6 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
LRCH2Q5VUJ6 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
LRCH2Q5VUJ6 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
LRCH2Q5VUJ6 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
LRCH2Q5VUJ6 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
LRCH2Q5VUJ6 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
LRCH2Q5VUJ6 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
LRCH2Q5VUJ6 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
LRCH2Q5VUJ6 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
LRCH2Q5VUJ6 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
LRCH2Q5VUJ6 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
LRCH2Q5VUJ6 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
LRCH2Q5VUJ6 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
LRCH2Q5VUJ6 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
LRCH2Q5VUJ6 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
LRCH2Q5VUJ6 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
LRCH2Q5VUJ6 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
LRCH2Q5VUJ6 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
LRCH2Q5VUJ6 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
LRCH2Q5VUJ6 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
LRCH2Q5VUJ6 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
LRCH2Q5VUJ6 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
LRCH2Q5VUJ6 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
LRCH2Q5VUJ6 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
LRCH2Q5VUJ6 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
LRCH2Q5VUJ6 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
LRCH2Q5VUJ6 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
LRCH2Q5VUJ6 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
LRCH2Q5VUJ6 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
LRCH2Q5VUJ6 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
LRCH2Q5VUJ6 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
LRCH2Q5VUJ6 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
LRCH2Q5VUJ6 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
LRCH2Q5VUJ6 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
LRCH2Q5VUJ6 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
LRCH2Q5VUJ6 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
LRCH2Q5VUJ6 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
LRCH2Q5VUJ6 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
LRCH2Q5VUJ6 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
LRCH2Q5VUJ6 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
LRCH2Q5VUJ6 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
LRCH2Q5VUJ6 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
LRCH2Q5VUJ6 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
LRCH2Q5VUJ6 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
LRCH2Q5VUJ6 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
LRCH2Q5VUJ6 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
LRCH2Q5VUJ6 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
LRCH2Q5VUJ6 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
LRCH2Q5VUJ6 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
LRCH2Q5VUJ6 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
LRCH2Q5VUJ6 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
LRCH2Q5VUJ6 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
LRCH2Q5VUJ6 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
LRCH2Q5VUJ6 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
LRCH2Q5VUJ6 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC26.3■■□□□ 1.8
LRCH2Q5VUJ6 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
LRCH2Q5VUJ6 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
LRCH2Q5VUJ6 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
LRCH2Q5VUJ6 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
LRCH2Q5VUJ6 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
LRCH2Q5VUJ6 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
LRCH2Q5VUJ6 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
LRCH2Q5VUJ6 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
LRCH2Q5VUJ6 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
LRCH2Q5VUJ6 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
LRCH2Q5VUJ6 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
LRCH2Q5VUJ6 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
LRCH2Q5VUJ6 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
LRCH2Q5VUJ6 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
LRCH2Q5VUJ6 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
LRCH2Q5VUJ6 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
LRCH2Q5VUJ6 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
LRCH2Q5VUJ6 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
LRCH2Q5VUJ6 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC26.27■■□□□ 1.8
LRCH2Q5VUJ6 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
LRCH2Q5VUJ6 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
LRCH2Q5VUJ6 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
LRCH2Q5VUJ6 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
LRCH2Q5VUJ6 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
LRCH2Q5VUJ6 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
LRCH2Q5VUJ6 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
LRCH2Q5VUJ6 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
LRCH2Q5VUJ6 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
LRCH2Q5VUJ6 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
LRCH2Q5VUJ6 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
LRCH2Q5VUJ6 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
LRCH2Q5VUJ6 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
LRCH2Q5VUJ6 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC26.25■■□□□ 1.79
LRCH2Q5VUJ6 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
LRCH2Q5VUJ6 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
LRCH2Q5VUJ6 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
LRCH2Q5VUJ6 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
LRCH2Q5VUJ6 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
LRCH2Q5VUJ6 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
LRCH2Q5VUJ6 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
LRCH2Q5VUJ6 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
LRCH2Q5VUJ6 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms