Protein–RNA interactions for Protein: Q5VU97

CACHD1, VWFA and cache domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACHD1Q5VU97 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CACHD1Q5VU97 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CACHD1Q5VU97 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CACHD1Q5VU97 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CACHD1Q5VU97 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CACHD1Q5VU97 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CACHD1Q5VU97 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CACHD1Q5VU97 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CACHD1Q5VU97 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CACHD1Q5VU97 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CACHD1Q5VU97 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CACHD1Q5VU97 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CACHD1Q5VU97 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CACHD1Q5VU97 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CACHD1Q5VU97 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CACHD1Q5VU97 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CACHD1Q5VU97 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CACHD1Q5VU97 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CACHD1Q5VU97 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CACHD1Q5VU97 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CACHD1Q5VU97 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CACHD1Q5VU97 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CACHD1Q5VU97 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CACHD1Q5VU97 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CACHD1Q5VU97 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CACHD1Q5VU97 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CACHD1Q5VU97 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CACHD1Q5VU97 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CACHD1Q5VU97 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CACHD1Q5VU97 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CACHD1Q5VU97 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CACHD1Q5VU97 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CACHD1Q5VU97 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CACHD1Q5VU97 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CACHD1Q5VU97 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CACHD1Q5VU97 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CACHD1Q5VU97 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CACHD1Q5VU97 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CACHD1Q5VU97 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CACHD1Q5VU97 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CACHD1Q5VU97 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CACHD1Q5VU97 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CACHD1Q5VU97 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CACHD1Q5VU97 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CACHD1Q5VU97 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CACHD1Q5VU97 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CACHD1Q5VU97 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CACHD1Q5VU97 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CACHD1Q5VU97 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CACHD1Q5VU97 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CACHD1Q5VU97 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CACHD1Q5VU97 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CACHD1Q5VU97 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CACHD1Q5VU97 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CACHD1Q5VU97 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CACHD1Q5VU97 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CACHD1Q5VU97 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CACHD1Q5VU97 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CACHD1Q5VU97 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CACHD1Q5VU97 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CACHD1Q5VU97 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CACHD1Q5VU97 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CACHD1Q5VU97 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CACHD1Q5VU97 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CACHD1Q5VU97 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CACHD1Q5VU97 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CACHD1Q5VU97 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CACHD1Q5VU97 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CACHD1Q5VU97 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CACHD1Q5VU97 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CACHD1Q5VU97 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CACHD1Q5VU97 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CACHD1Q5VU97 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CACHD1Q5VU97 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CACHD1Q5VU97 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CACHD1Q5VU97 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CACHD1Q5VU97 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CACHD1Q5VU97 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CACHD1Q5VU97 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CACHD1Q5VU97 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CACHD1Q5VU97 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CACHD1Q5VU97 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CACHD1Q5VU97 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CACHD1Q5VU97 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CACHD1Q5VU97 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CACHD1Q5VU97 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CACHD1Q5VU97 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CACHD1Q5VU97 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CACHD1Q5VU97 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CACHD1Q5VU97 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CACHD1Q5VU97 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CACHD1Q5VU97 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CACHD1Q5VU97 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
CACHD1Q5VU97 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CACHD1Q5VU97 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CACHD1Q5VU97 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CACHD1Q5VU97 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CACHD1Q5VU97 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CACHD1Q5VU97 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CACHD1Q5VU97 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms