Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTR2

RNF20, E3 ubiquitin-protein ligase BRE1A, humanhuman

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF20Q5VTR2 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
RNF20Q5VTR2 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RNF20Q5VTR2 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RNF20Q5VTR2 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
RNF20Q5VTR2 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
RNF20Q5VTR2 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RNF20Q5VTR2 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
RNF20Q5VTR2 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
RNF20Q5VTR2 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RNF20Q5VTR2 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RNF20Q5VTR2 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
RNF20Q5VTR2 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
RNF20Q5VTR2 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
RNF20Q5VTR2 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
RNF20Q5VTR2 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
RNF20Q5VTR2 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
RNF20Q5VTR2 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
RNF20Q5VTR2 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
RNF20Q5VTR2 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
RNF20Q5VTR2 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
RNF20Q5VTR2 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
RNF20Q5VTR2 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
RNF20Q5VTR2 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
RNF20Q5VTR2 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
RNF20Q5VTR2 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
RNF20Q5VTR2 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
RNF20Q5VTR2 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
RNF20Q5VTR2 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
RNF20Q5VTR2 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
RNF20Q5VTR2 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RNF20Q5VTR2 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
RNF20Q5VTR2 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RNF20Q5VTR2 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
RNF20Q5VTR2 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
RNF20Q5VTR2 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RNF20Q5VTR2 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
RNF20Q5VTR2 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RNF20Q5VTR2 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
RNF20Q5VTR2 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RNF20Q5VTR2 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
RNF20Q5VTR2 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
RNF20Q5VTR2 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
RNF20Q5VTR2 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
RNF20Q5VTR2 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RNF20Q5VTR2 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RNF20Q5VTR2 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
RNF20Q5VTR2 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
RNF20Q5VTR2 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
RNF20Q5VTR2 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RNF20Q5VTR2 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
RNF20Q5VTR2 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
RNF20Q5VTR2 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
RNF20Q5VTR2 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
RNF20Q5VTR2 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
RNF20Q5VTR2 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
RNF20Q5VTR2 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
RNF20Q5VTR2 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
RNF20Q5VTR2 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
RNF20Q5VTR2 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
RNF20Q5VTR2 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
RNF20Q5VTR2 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
RNF20Q5VTR2 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
RNF20Q5VTR2 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
RNF20Q5VTR2 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.04
RNF20Q5VTR2 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
RNF20Q5VTR2 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
RNF20Q5VTR2 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
RNF20Q5VTR2 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
RNF20Q5VTR2 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
RNF20Q5VTR2 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
RNF20Q5VTR2 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RNF20Q5VTR2 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
RNF20Q5VTR2 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RNF20Q5VTR2 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
RNF20Q5VTR2 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RNF20Q5VTR2 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RNF20Q5VTR2 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
RNF20Q5VTR2 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RNF20Q5VTR2 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
RNF20Q5VTR2 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
RNF20Q5VTR2 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RNF20Q5VTR2 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RNF20Q5VTR2 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RNF20Q5VTR2 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
RNF20Q5VTR2 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RNF20Q5VTR2 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
RNF20Q5VTR2 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
RNF20Q5VTR2 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RNF20Q5VTR2 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RNF20Q5VTR2 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
RNF20Q5VTR2 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RNF20Q5VTR2 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RNF20Q5VTR2 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
RNF20Q5VTR2 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
RNF20Q5VTR2 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
RNF20Q5VTR2 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RNF20Q5VTR2 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RNF20Q5VTR2 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RNF20Q5VTR2 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RNF20Q5VTR2 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms