Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT97

SYDE2, Rho GTPase-activating protein SYDE2, humanhuman

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYDE2Q5VT97 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SYDE2Q5VT97 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SYDE2Q5VT97 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SYDE2Q5VT97 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SYDE2Q5VT97 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SYDE2Q5VT97 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SYDE2Q5VT97 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SYDE2Q5VT97 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SYDE2Q5VT97 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SYDE2Q5VT97 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
SYDE2Q5VT97 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SYDE2Q5VT97 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SYDE2Q5VT97 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SYDE2Q5VT97 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SYDE2Q5VT97 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SYDE2Q5VT97 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SYDE2Q5VT97 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SYDE2Q5VT97 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SYDE2Q5VT97 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SYDE2Q5VT97 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SYDE2Q5VT97 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SYDE2Q5VT97 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SYDE2Q5VT97 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SYDE2Q5VT97 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
SYDE2Q5VT97 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SYDE2Q5VT97 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SYDE2Q5VT97 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SYDE2Q5VT97 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SYDE2Q5VT97 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SYDE2Q5VT97 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
SYDE2Q5VT97 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC27■■□□□ 1.91
SYDE2Q5VT97 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SYDE2Q5VT97 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC27■■□□□ 1.91
SYDE2Q5VT97 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
SYDE2Q5VT97 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
SYDE2Q5VT97 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC27■■□□□ 1.91
SYDE2Q5VT97 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SYDE2Q5VT97 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SYDE2Q5VT97 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SYDE2Q5VT97 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SYDE2Q5VT97 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SYDE2Q5VT97 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SYDE2Q5VT97 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SYDE2Q5VT97 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SYDE2Q5VT97 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SYDE2Q5VT97 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SYDE2Q5VT97 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SYDE2Q5VT97 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SYDE2Q5VT97 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SYDE2Q5VT97 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SYDE2Q5VT97 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SYDE2Q5VT97 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SYDE2Q5VT97 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SYDE2Q5VT97 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SYDE2Q5VT97 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SYDE2Q5VT97 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SYDE2Q5VT97 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
SYDE2Q5VT97 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SYDE2Q5VT97 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SYDE2Q5VT97 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SYDE2Q5VT97 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
SYDE2Q5VT97 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
SYDE2Q5VT97 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SYDE2Q5VT97 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SYDE2Q5VT97 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SYDE2Q5VT97 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SYDE2Q5VT97 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SYDE2Q5VT97 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SYDE2Q5VT97 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SYDE2Q5VT97 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SYDE2Q5VT97 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SYDE2Q5VT97 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SYDE2Q5VT97 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SYDE2Q5VT97 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SYDE2Q5VT97 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SYDE2Q5VT97 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
SYDE2Q5VT97 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
SYDE2Q5VT97 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
SYDE2Q5VT97 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
SYDE2Q5VT97 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SYDE2Q5VT97 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SYDE2Q5VT97 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SYDE2Q5VT97 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SYDE2Q5VT97 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SYDE2Q5VT97 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SYDE2Q5VT97 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SYDE2Q5VT97 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SYDE2Q5VT97 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SYDE2Q5VT97 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SYDE2Q5VT97 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SYDE2Q5VT97 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SYDE2Q5VT97 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SYDE2Q5VT97 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SYDE2Q5VT97 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SYDE2Q5VT97 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SYDE2Q5VT97 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SYDE2Q5VT97 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SYDE2Q5VT97 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SYDE2Q5VT97 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SYDE2Q5VT97 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.2 ms