Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT06

CEP350, Centrosome-associated protein 350, humanhuman

Predictions only

Length 3,117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP350Q5VT06 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CEP350Q5VT06 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CEP350Q5VT06 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CEP350Q5VT06 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CEP350Q5VT06 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.08
CEP350Q5VT06 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC28.01■■■□□ 2.08
CEP350Q5VT06 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.08
CEP350Q5VT06 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.08
CEP350Q5VT06 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CEP350Q5VT06 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CEP350Q5VT06 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CEP350Q5VT06 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC28■■■□□ 2.07
CEP350Q5VT06 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
CEP350Q5VT06 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CEP350Q5VT06 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC28■■■□□ 2.07
CEP350Q5VT06 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CEP350Q5VT06 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CEP350Q5VT06 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CEP350Q5VT06 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CEP350Q5VT06 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CEP350Q5VT06 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CEP350Q5VT06 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CEP350Q5VT06 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CEP350Q5VT06 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CEP350Q5VT06 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CEP350Q5VT06 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CEP350Q5VT06 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CEP350Q5VT06 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CEP350Q5VT06 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CEP350Q5VT06 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CEP350Q5VT06 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CEP350Q5VT06 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CEP350Q5VT06 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CEP350Q5VT06 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CEP350Q5VT06 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CEP350Q5VT06 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CEP350Q5VT06 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CEP350Q5VT06 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CEP350Q5VT06 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CEP350Q5VT06 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CEP350Q5VT06 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CEP350Q5VT06 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CEP350Q5VT06 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CEP350Q5VT06 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CEP350Q5VT06 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CEP350Q5VT06 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
CEP350Q5VT06 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
CEP350Q5VT06 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CEP350Q5VT06 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CEP350Q5VT06 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CEP350Q5VT06 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CEP350Q5VT06 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
CEP350Q5VT06 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CEP350Q5VT06 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CEP350Q5VT06 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CEP350Q5VT06 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CEP350Q5VT06 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CEP350Q5VT06 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CEP350Q5VT06 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CEP350Q5VT06 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CEP350Q5VT06 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
CEP350Q5VT06 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CEP350Q5VT06 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CEP350Q5VT06 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CEP350Q5VT06 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CEP350Q5VT06 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
CEP350Q5VT06 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
CEP350Q5VT06 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
CEP350Q5VT06 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CEP350Q5VT06 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CEP350Q5VT06 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CEP350Q5VT06 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CEP350Q5VT06 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
CEP350Q5VT06 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CEP350Q5VT06 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
CEP350Q5VT06 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CEP350Q5VT06 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CEP350Q5VT06 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CEP350Q5VT06 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CEP350Q5VT06 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
CEP350Q5VT06 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CEP350Q5VT06 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
CEP350Q5VT06 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC27.89■■■□□ 2.05
CEP350Q5VT06 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
CEP350Q5VT06 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CEP350Q5VT06 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CEP350Q5VT06 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CEP350Q5VT06 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
CEP350Q5VT06 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CEP350Q5VT06 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CEP350Q5VT06 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CEP350Q5VT06 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CEP350Q5VT06 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CEP350Q5VT06 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CEP350Q5VT06 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CEP350Q5VT06 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
CEP350Q5VT06 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CEP350Q5VT06 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CEP350Q5VT06 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CEP350Q5VT06 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms