Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGJ6

HDGFL1, Hepatoma-derived growth factor-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDGFL1Q5TGJ6 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC30■■■□□ 2.39
HDGFL1Q5TGJ6 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
HDGFL1Q5TGJ6 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
HDGFL1Q5TGJ6 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
HDGFL1Q5TGJ6 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
HDGFL1Q5TGJ6 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
HDGFL1Q5TGJ6 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC29.99■■■□□ 2.39
HDGFL1Q5TGJ6 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
HDGFL1Q5TGJ6 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
HDGFL1Q5TGJ6 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
HDGFL1Q5TGJ6 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
HDGFL1Q5TGJ6 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
HDGFL1Q5TGJ6 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
HDGFL1Q5TGJ6 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
HDGFL1Q5TGJ6 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
HDGFL1Q5TGJ6 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
HDGFL1Q5TGJ6 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC29.97■■■□□ 2.39
HDGFL1Q5TGJ6 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
HDGFL1Q5TGJ6 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
HDGFL1Q5TGJ6 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
HDGFL1Q5TGJ6 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
HDGFL1Q5TGJ6 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
HDGFL1Q5TGJ6 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
HDGFL1Q5TGJ6 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
HDGFL1Q5TGJ6 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
HDGFL1Q5TGJ6 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
HDGFL1Q5TGJ6 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
HDGFL1Q5TGJ6 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
HDGFL1Q5TGJ6 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC29.95■■■□□ 2.39
HDGFL1Q5TGJ6 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
HDGFL1Q5TGJ6 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
HDGFL1Q5TGJ6 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC29.95■■■□□ 2.38
HDGFL1Q5TGJ6 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
HDGFL1Q5TGJ6 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
HDGFL1Q5TGJ6 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
HDGFL1Q5TGJ6 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
HDGFL1Q5TGJ6 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
HDGFL1Q5TGJ6 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
HDGFL1Q5TGJ6 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
HDGFL1Q5TGJ6 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
HDGFL1Q5TGJ6 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
HDGFL1Q5TGJ6 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
HDGFL1Q5TGJ6 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
HDGFL1Q5TGJ6 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
HDGFL1Q5TGJ6 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
HDGFL1Q5TGJ6 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
HDGFL1Q5TGJ6 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
HDGFL1Q5TGJ6 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
HDGFL1Q5TGJ6 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
HDGFL1Q5TGJ6 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
HDGFL1Q5TGJ6 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
HDGFL1Q5TGJ6 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
HDGFL1Q5TGJ6 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
HDGFL1Q5TGJ6 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
HDGFL1Q5TGJ6 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
HDGFL1Q5TGJ6 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
HDGFL1Q5TGJ6 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
HDGFL1Q5TGJ6 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
HDGFL1Q5TGJ6 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
HDGFL1Q5TGJ6 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
HDGFL1Q5TGJ6 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
HDGFL1Q5TGJ6 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
HDGFL1Q5TGJ6 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
HDGFL1Q5TGJ6 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
HDGFL1Q5TGJ6 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
HDGFL1Q5TGJ6 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
HDGFL1Q5TGJ6 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
HDGFL1Q5TGJ6 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
HDGFL1Q5TGJ6 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.37
HDGFL1Q5TGJ6 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
HDGFL1Q5TGJ6 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
HDGFL1Q5TGJ6 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
HDGFL1Q5TGJ6 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
HDGFL1Q5TGJ6 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
HDGFL1Q5TGJ6 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
HDGFL1Q5TGJ6 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
HDGFL1Q5TGJ6 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
HDGFL1Q5TGJ6 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
HDGFL1Q5TGJ6 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
HDGFL1Q5TGJ6 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
HDGFL1Q5TGJ6 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC29.87■■■□□ 2.37
HDGFL1Q5TGJ6 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
HDGFL1Q5TGJ6 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
HDGFL1Q5TGJ6 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
HDGFL1Q5TGJ6 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
HDGFL1Q5TGJ6 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC29.86■■■□□ 2.37
HDGFL1Q5TGJ6 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
HDGFL1Q5TGJ6 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
HDGFL1Q5TGJ6 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
HDGFL1Q5TGJ6 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
HDGFL1Q5TGJ6 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
HDGFL1Q5TGJ6 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
HDGFL1Q5TGJ6 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
HDGFL1Q5TGJ6 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
HDGFL1Q5TGJ6 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
HDGFL1Q5TGJ6 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
HDGFL1Q5TGJ6 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
HDGFL1Q5TGJ6 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
HDGFL1Q5TGJ6 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
HDGFL1Q5TGJ6 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms