Protein–RNA interactions for Protein: Q5TAH2

SLC9C2, Sodium/hydrogen exchanger 11, humanhuman

Predictions only

Length 1,124 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9C2Q5TAH2 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SLC9C2Q5TAH2 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SLC9C2Q5TAH2 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SLC9C2Q5TAH2 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC28.2■■■□□ 2.11
SLC9C2Q5TAH2 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.11
SLC9C2Q5TAH2 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SLC9C2Q5TAH2 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
SLC9C2Q5TAH2 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
SLC9C2Q5TAH2 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
SLC9C2Q5TAH2 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC28.2■■■□□ 2.1
SLC9C2Q5TAH2 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SLC9C2Q5TAH2 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SLC9C2Q5TAH2 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SLC9C2Q5TAH2 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SLC9C2Q5TAH2 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SLC9C2Q5TAH2 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SLC9C2Q5TAH2 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SLC9C2Q5TAH2 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SLC9C2Q5TAH2 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SLC9C2Q5TAH2 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SLC9C2Q5TAH2 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SLC9C2Q5TAH2 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SLC9C2Q5TAH2 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SLC9C2Q5TAH2 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SLC9C2Q5TAH2 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SLC9C2Q5TAH2 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SLC9C2Q5TAH2 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SLC9C2Q5TAH2 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SLC9C2Q5TAH2 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SLC9C2Q5TAH2 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SLC9C2Q5TAH2 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SLC9C2Q5TAH2 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SLC9C2Q5TAH2 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SLC9C2Q5TAH2 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SLC9C2Q5TAH2 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SLC9C2Q5TAH2 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SLC9C2Q5TAH2 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SLC9C2Q5TAH2 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
SLC9C2Q5TAH2 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SLC9C2Q5TAH2 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SLC9C2Q5TAH2 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SLC9C2Q5TAH2 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SLC9C2Q5TAH2 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SLC9C2Q5TAH2 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SLC9C2Q5TAH2 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SLC9C2Q5TAH2 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
SLC9C2Q5TAH2 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SLC9C2Q5TAH2 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SLC9C2Q5TAH2 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SLC9C2Q5TAH2 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SLC9C2Q5TAH2 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SLC9C2Q5TAH2 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SLC9C2Q5TAH2 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SLC9C2Q5TAH2 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SLC9C2Q5TAH2 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SLC9C2Q5TAH2 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SLC9C2Q5TAH2 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SLC9C2Q5TAH2 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SLC9C2Q5TAH2 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SLC9C2Q5TAH2 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SLC9C2Q5TAH2 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SLC9C2Q5TAH2 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SLC9C2Q5TAH2 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SLC9C2Q5TAH2 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SLC9C2Q5TAH2 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SLC9C2Q5TAH2 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SLC9C2Q5TAH2 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SLC9C2Q5TAH2 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SLC9C2Q5TAH2 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SLC9C2Q5TAH2 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SLC9C2Q5TAH2 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SLC9C2Q5TAH2 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SLC9C2Q5TAH2 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SLC9C2Q5TAH2 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SLC9C2Q5TAH2 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
SLC9C2Q5TAH2 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SLC9C2Q5TAH2 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SLC9C2Q5TAH2 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SLC9C2Q5TAH2 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
SLC9C2Q5TAH2 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SLC9C2Q5TAH2 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SLC9C2Q5TAH2 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SLC9C2Q5TAH2 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SLC9C2Q5TAH2 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SLC9C2Q5TAH2 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SLC9C2Q5TAH2 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SLC9C2Q5TAH2 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SLC9C2Q5TAH2 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SLC9C2Q5TAH2 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SLC9C2Q5TAH2 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SLC9C2Q5TAH2 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SLC9C2Q5TAH2 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SLC9C2Q5TAH2 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SLC9C2Q5TAH2 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
SLC9C2Q5TAH2 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SLC9C2Q5TAH2 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SLC9C2Q5TAH2 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SLC9C2Q5TAH2 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SLC9C2Q5TAH2 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SLC9C2Q5TAH2 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms