Protein–RNA interactions for Protein: Q5T7P6

TMEM78, Transmembrane protein 78, humanhuman

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM78Q5T7P6 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TMEM78Q5T7P6 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TMEM78Q5T7P6 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TMEM78Q5T7P6 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TMEM78Q5T7P6 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
TMEM78Q5T7P6 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
TMEM78Q5T7P6 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TMEM78Q5T7P6 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TMEM78Q5T7P6 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TMEM78Q5T7P6 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TMEM78Q5T7P6 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TMEM78Q5T7P6 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TMEM78Q5T7P6 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TMEM78Q5T7P6 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TMEM78Q5T7P6 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TMEM78Q5T7P6 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TMEM78Q5T7P6 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TMEM78Q5T7P6 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TMEM78Q5T7P6 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TMEM78Q5T7P6 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TMEM78Q5T7P6 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TMEM78Q5T7P6 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TMEM78Q5T7P6 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TMEM78Q5T7P6 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TMEM78Q5T7P6 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TMEM78Q5T7P6 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TMEM78Q5T7P6 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TMEM78Q5T7P6 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TMEM78Q5T7P6 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TMEM78Q5T7P6 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TMEM78Q5T7P6 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TMEM78Q5T7P6 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TMEM78Q5T7P6 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TMEM78Q5T7P6 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TMEM78Q5T7P6 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TMEM78Q5T7P6 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TMEM78Q5T7P6 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TMEM78Q5T7P6 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TMEM78Q5T7P6 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TMEM78Q5T7P6 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TMEM78Q5T7P6 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TMEM78Q5T7P6 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TMEM78Q5T7P6 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TMEM78Q5T7P6 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TMEM78Q5T7P6 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TMEM78Q5T7P6 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TMEM78Q5T7P6 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TMEM78Q5T7P6 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TMEM78Q5T7P6 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TMEM78Q5T7P6 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TMEM78Q5T7P6 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TMEM78Q5T7P6 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TMEM78Q5T7P6 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TMEM78Q5T7P6 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TMEM78Q5T7P6 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TMEM78Q5T7P6 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TMEM78Q5T7P6 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TMEM78Q5T7P6 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TMEM78Q5T7P6 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TMEM78Q5T7P6 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TMEM78Q5T7P6 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TMEM78Q5T7P6 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TMEM78Q5T7P6 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TMEM78Q5T7P6 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TMEM78Q5T7P6 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TMEM78Q5T7P6 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TMEM78Q5T7P6 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TMEM78Q5T7P6 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TMEM78Q5T7P6 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TMEM78Q5T7P6 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TMEM78Q5T7P6 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
TMEM78Q5T7P6 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TMEM78Q5T7P6 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TMEM78Q5T7P6 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
TMEM78Q5T7P6 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
TMEM78Q5T7P6 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
TMEM78Q5T7P6 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
TMEM78Q5T7P6 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMEM78Q5T7P6 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMEM78Q5T7P6 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMEM78Q5T7P6 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMEM78Q5T7P6 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMEM78Q5T7P6 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMEM78Q5T7P6 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMEM78Q5T7P6 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMEM78Q5T7P6 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMEM78Q5T7P6 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMEM78Q5T7P6 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TMEM78Q5T7P6 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TMEM78Q5T7P6 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TMEM78Q5T7P6 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TMEM78Q5T7P6 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TMEM78Q5T7P6 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TMEM78Q5T7P6 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TMEM78Q5T7P6 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TMEM78Q5T7P6 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TMEM78Q5T7P6 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TMEM78Q5T7P6 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TMEM78Q5T7P6 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TMEM78Q5T7P6 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.4 ms