Protein–RNA interactions for Protein: Q5T619

ZNF648, Zinc finger protein 648, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF648Q5T619 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZNF648Q5T619 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZNF648Q5T619 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZNF648Q5T619 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZNF648Q5T619 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZNF648Q5T619 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZNF648Q5T619 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZNF648Q5T619 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZNF648Q5T619 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZNF648Q5T619 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZNF648Q5T619 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZNF648Q5T619 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
ZNF648Q5T619 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZNF648Q5T619 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZNF648Q5T619 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZNF648Q5T619 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZNF648Q5T619 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZNF648Q5T619 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZNF648Q5T619 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZNF648Q5T619 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZNF648Q5T619 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZNF648Q5T619 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZNF648Q5T619 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZNF648Q5T619 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
ZNF648Q5T619 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZNF648Q5T619 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZNF648Q5T619 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZNF648Q5T619 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ZNF648Q5T619 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ZNF648Q5T619 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ZNF648Q5T619 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ZNF648Q5T619 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ZNF648Q5T619 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ZNF648Q5T619 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZNF648Q5T619 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZNF648Q5T619 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZNF648Q5T619 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
ZNF648Q5T619 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZNF648Q5T619 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZNF648Q5T619 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZNF648Q5T619 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZNF648Q5T619 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZNF648Q5T619 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZNF648Q5T619 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZNF648Q5T619 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZNF648Q5T619 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZNF648Q5T619 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZNF648Q5T619 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZNF648Q5T619 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZNF648Q5T619 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
ZNF648Q5T619 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
ZNF648Q5T619 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZNF648Q5T619 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZNF648Q5T619 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZNF648Q5T619 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZNF648Q5T619 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZNF648Q5T619 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZNF648Q5T619 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZNF648Q5T619 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZNF648Q5T619 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZNF648Q5T619 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZNF648Q5T619 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZNF648Q5T619 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZNF648Q5T619 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZNF648Q5T619 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZNF648Q5T619 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZNF648Q5T619 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZNF648Q5T619 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZNF648Q5T619 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ZNF648Q5T619 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ZNF648Q5T619 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZNF648Q5T619 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZNF648Q5T619 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZNF648Q5T619 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZNF648Q5T619 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
ZNF648Q5T619 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZNF648Q5T619 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZNF648Q5T619 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZNF648Q5T619 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNF648Q5T619 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNF648Q5T619 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNF648Q5T619 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNF648Q5T619 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNF648Q5T619 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNF648Q5T619 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF648Q5T619 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF648Q5T619 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF648Q5T619 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF648Q5T619 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF648Q5T619 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF648Q5T619 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZNF648Q5T619 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZNF648Q5T619 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZNF648Q5T619 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
ZNF648Q5T619 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZNF648Q5T619 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZNF648Q5T619 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZNF648Q5T619 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
ZNF648Q5T619 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZNF648Q5T619 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.9 ms