Protein–RNA interactions for Protein: Q5SXM1

ZNF678, Zinc finger protein 678, humanhuman

Predictions only

Length 525 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF678Q5SXM1 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF678Q5SXM1 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF678Q5SXM1 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF678Q5SXM1 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF678Q5SXM1 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF678Q5SXM1 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF678Q5SXM1 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF678Q5SXM1 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF678Q5SXM1 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF678Q5SXM1 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF678Q5SXM1 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF678Q5SXM1 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF678Q5SXM1 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF678Q5SXM1 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF678Q5SXM1 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF678Q5SXM1 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF678Q5SXM1 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF678Q5SXM1 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF678Q5SXM1 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF678Q5SXM1 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF678Q5SXM1 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF678Q5SXM1 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF678Q5SXM1 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF678Q5SXM1 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF678Q5SXM1 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF678Q5SXM1 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF678Q5SXM1 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF678Q5SXM1 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF678Q5SXM1 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF678Q5SXM1 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF678Q5SXM1 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF678Q5SXM1 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF678Q5SXM1 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF678Q5SXM1 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF678Q5SXM1 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF678Q5SXM1 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF678Q5SXM1 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF678Q5SXM1 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF678Q5SXM1 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF678Q5SXM1 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF678Q5SXM1 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF678Q5SXM1 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF678Q5SXM1 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF678Q5SXM1 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF678Q5SXM1 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF678Q5SXM1 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF678Q5SXM1 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF678Q5SXM1 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF678Q5SXM1 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF678Q5SXM1 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF678Q5SXM1 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF678Q5SXM1 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF678Q5SXM1 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF678Q5SXM1 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF678Q5SXM1 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF678Q5SXM1 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF678Q5SXM1 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF678Q5SXM1 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF678Q5SXM1 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF678Q5SXM1 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF678Q5SXM1 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF678Q5SXM1 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF678Q5SXM1 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF678Q5SXM1 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF678Q5SXM1 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF678Q5SXM1 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF678Q5SXM1 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF678Q5SXM1 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF678Q5SXM1 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF678Q5SXM1 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
ZNF678Q5SXM1 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
ZNF678Q5SXM1 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF678Q5SXM1 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF678Q5SXM1 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF678Q5SXM1 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF678Q5SXM1 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF678Q5SXM1 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF678Q5SXM1 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF678Q5SXM1 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF678Q5SXM1 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF678Q5SXM1 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF678Q5SXM1 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF678Q5SXM1 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF678Q5SXM1 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF678Q5SXM1 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF678Q5SXM1 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF678Q5SXM1 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF678Q5SXM1 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF678Q5SXM1 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF678Q5SXM1 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF678Q5SXM1 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF678Q5SXM1 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF678Q5SXM1 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF678Q5SXM1 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF678Q5SXM1 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF678Q5SXM1 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF678Q5SXM1 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF678Q5SXM1 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF678Q5SXM1 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF678Q5SXM1 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 126.8 ms