Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWL7

PRAMEF14, PRAME family member 14, humanhuman

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF14Q5SWL7 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRAMEF14Q5SWL7 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRAMEF14Q5SWL7 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRAMEF14Q5SWL7 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRAMEF14Q5SWL7 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRAMEF14Q5SWL7 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRAMEF14Q5SWL7 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRAMEF14Q5SWL7 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRAMEF14Q5SWL7 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRAMEF14Q5SWL7 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRAMEF14Q5SWL7 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRAMEF14Q5SWL7 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRAMEF14Q5SWL7 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRAMEF14Q5SWL7 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRAMEF14Q5SWL7 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PRAMEF14Q5SWL7 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRAMEF14Q5SWL7 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRAMEF14Q5SWL7 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRAMEF14Q5SWL7 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRAMEF14Q5SWL7 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRAMEF14Q5SWL7 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRAMEF14Q5SWL7 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRAMEF14Q5SWL7 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PRAMEF14Q5SWL7 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRAMEF14Q5SWL7 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRAMEF14Q5SWL7 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRAMEF14Q5SWL7 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRAMEF14Q5SWL7 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRAMEF14Q5SWL7 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRAMEF14Q5SWL7 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRAMEF14Q5SWL7 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRAMEF14Q5SWL7 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRAMEF14Q5SWL7 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRAMEF14Q5SWL7 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PRAMEF14Q5SWL7 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PRAMEF14Q5SWL7 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PRAMEF14Q5SWL7 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PRAMEF14Q5SWL7 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PRAMEF14Q5SWL7 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PRAMEF14Q5SWL7 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRAMEF14Q5SWL7 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRAMEF14Q5SWL7 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRAMEF14Q5SWL7 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRAMEF14Q5SWL7 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRAMEF14Q5SWL7 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PRAMEF14Q5SWL7 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRAMEF14Q5SWL7 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRAMEF14Q5SWL7 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRAMEF14Q5SWL7 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRAMEF14Q5SWL7 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRAMEF14Q5SWL7 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRAMEF14Q5SWL7 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRAMEF14Q5SWL7 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRAMEF14Q5SWL7 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRAMEF14Q5SWL7 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRAMEF14Q5SWL7 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRAMEF14Q5SWL7 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRAMEF14Q5SWL7 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRAMEF14Q5SWL7 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRAMEF14Q5SWL7 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRAMEF14Q5SWL7 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRAMEF14Q5SWL7 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRAMEF14Q5SWL7 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRAMEF14Q5SWL7 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRAMEF14Q5SWL7 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRAMEF14Q5SWL7 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRAMEF14Q5SWL7 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRAMEF14Q5SWL7 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRAMEF14Q5SWL7 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
PRAMEF14Q5SWL7 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
PRAMEF14Q5SWL7 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRAMEF14Q5SWL7 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
PRAMEF14Q5SWL7 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRAMEF14Q5SWL7 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRAMEF14Q5SWL7 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
PRAMEF14Q5SWL7 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRAMEF14Q5SWL7 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRAMEF14Q5SWL7 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRAMEF14Q5SWL7 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRAMEF14Q5SWL7 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRAMEF14Q5SWL7 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRAMEF14Q5SWL7 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRAMEF14Q5SWL7 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRAMEF14Q5SWL7 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRAMEF14Q5SWL7 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRAMEF14Q5SWL7 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRAMEF14Q5SWL7 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRAMEF14Q5SWL7 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRAMEF14Q5SWL7 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PRAMEF14Q5SWL7 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRAMEF14Q5SWL7 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRAMEF14Q5SWL7 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
PRAMEF14Q5SWL7 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRAMEF14Q5SWL7 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRAMEF14Q5SWL7 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRAMEF14Q5SWL7 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRAMEF14Q5SWL7 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRAMEF14Q5SWL7 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRAMEF14Q5SWL7 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRAMEF14Q5SWL7 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms