Protein–RNA interactions for Protein: Q5MAI5

CDKL4, Cyclin-dependent kinase-like 4, humanhuman

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKL4Q5MAI5 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDKL4Q5MAI5 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDKL4Q5MAI5 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDKL4Q5MAI5 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDKL4Q5MAI5 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDKL4Q5MAI5 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDKL4Q5MAI5 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDKL4Q5MAI5 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDKL4Q5MAI5 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDKL4Q5MAI5 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDKL4Q5MAI5 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDKL4Q5MAI5 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDKL4Q5MAI5 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDKL4Q5MAI5 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDKL4Q5MAI5 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDKL4Q5MAI5 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDKL4Q5MAI5 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDKL4Q5MAI5 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDKL4Q5MAI5 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDKL4Q5MAI5 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDKL4Q5MAI5 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDKL4Q5MAI5 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDKL4Q5MAI5 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDKL4Q5MAI5 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDKL4Q5MAI5 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDKL4Q5MAI5 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDKL4Q5MAI5 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDKL4Q5MAI5 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDKL4Q5MAI5 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CDKL4Q5MAI5 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CDKL4Q5MAI5 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDKL4Q5MAI5 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDKL4Q5MAI5 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDKL4Q5MAI5 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDKL4Q5MAI5 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDKL4Q5MAI5 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDKL4Q5MAI5 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CDKL4Q5MAI5 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
CDKL4Q5MAI5 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDKL4Q5MAI5 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDKL4Q5MAI5 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CDKL4Q5MAI5 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDKL4Q5MAI5 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDKL4Q5MAI5 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDKL4Q5MAI5 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDKL4Q5MAI5 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDKL4Q5MAI5 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDKL4Q5MAI5 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDKL4Q5MAI5 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDKL4Q5MAI5 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDKL4Q5MAI5 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDKL4Q5MAI5 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDKL4Q5MAI5 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDKL4Q5MAI5 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDKL4Q5MAI5 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDKL4Q5MAI5 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDKL4Q5MAI5 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDKL4Q5MAI5 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CDKL4Q5MAI5 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDKL4Q5MAI5 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CDKL4Q5MAI5 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDKL4Q5MAI5 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDKL4Q5MAI5 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDKL4Q5MAI5 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDKL4Q5MAI5 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDKL4Q5MAI5 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDKL4Q5MAI5 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDKL4Q5MAI5 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CDKL4Q5MAI5 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDKL4Q5MAI5 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CDKL4Q5MAI5 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDKL4Q5MAI5 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDKL4Q5MAI5 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDKL4Q5MAI5 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDKL4Q5MAI5 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDKL4Q5MAI5 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDKL4Q5MAI5 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDKL4Q5MAI5 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDKL4Q5MAI5 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDKL4Q5MAI5 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDKL4Q5MAI5 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDKL4Q5MAI5 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CDKL4Q5MAI5 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDKL4Q5MAI5 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDKL4Q5MAI5 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDKL4Q5MAI5 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDKL4Q5MAI5 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDKL4Q5MAI5 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDKL4Q5MAI5 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDKL4Q5MAI5 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDKL4Q5MAI5 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CDKL4Q5MAI5 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CDKL4Q5MAI5 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDKL4Q5MAI5 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDKL4Q5MAI5 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDKL4Q5MAI5 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDKL4Q5MAI5 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDKL4Q5MAI5 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDKL4Q5MAI5 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDKL4Q5MAI5 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms