Protein–RNA interactions for Protein: Q5K4L6

SLC27A3, Long-chain fatty acid transport protein 3, humanhuman

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Length 730 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A3Q5K4L6 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
SLC27A3Q5K4L6 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
SLC27A3Q5K4L6 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
SLC27A3Q5K4L6 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
SLC27A3Q5K4L6 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
SLC27A3Q5K4L6 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
SLC27A3Q5K4L6 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
SLC27A3Q5K4L6 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.17■■■□□ 2.42
SLC27A3Q5K4L6 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
SLC27A3Q5K4L6 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
SLC27A3Q5K4L6 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
SLC27A3Q5K4L6 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
SLC27A3Q5K4L6 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
SLC27A3Q5K4L6 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
SLC27A3Q5K4L6 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
SLC27A3Q5K4L6 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC30.15■■■□□ 2.42
SLC27A3Q5K4L6 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
SLC27A3Q5K4L6 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
SLC27A3Q5K4L6 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.13■■■□□ 2.41
SLC27A3Q5K4L6 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
SLC27A3Q5K4L6 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
SLC27A3Q5K4L6 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
SLC27A3Q5K4L6 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
SLC27A3Q5K4L6 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
SLC27A3Q5K4L6 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC30.12■■■□□ 2.41
SLC27A3Q5K4L6 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
SLC27A3Q5K4L6 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
SLC27A3Q5K4L6 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
SLC27A3Q5K4L6 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
SLC27A3Q5K4L6 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
SLC27A3Q5K4L6 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
SLC27A3Q5K4L6 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
SLC27A3Q5K4L6 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
SLC27A3Q5K4L6 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
SLC27A3Q5K4L6 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
SLC27A3Q5K4L6 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
SLC27A3Q5K4L6 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
SLC27A3Q5K4L6 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
SLC27A3Q5K4L6 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
SLC27A3Q5K4L6 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
SLC27A3Q5K4L6 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
SLC27A3Q5K4L6 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC30.08■■■□□ 2.41
SLC27A3Q5K4L6 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
SLC27A3Q5K4L6 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
SLC27A3Q5K4L6 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC30.08■■■□□ 2.41
SLC27A3Q5K4L6 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
SLC27A3Q5K4L6 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
SLC27A3Q5K4L6 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
SLC27A3Q5K4L6 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
SLC27A3Q5K4L6 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC30.06■■■□□ 2.4
SLC27A3Q5K4L6 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
SLC27A3Q5K4L6 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
SLC27A3Q5K4L6 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
SLC27A3Q5K4L6 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
SLC27A3Q5K4L6 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
SLC27A3Q5K4L6 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
SLC27A3Q5K4L6 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
SLC27A3Q5K4L6 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
SLC27A3Q5K4L6 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
SLC27A3Q5K4L6 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
SLC27A3Q5K4L6 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
SLC27A3Q5K4L6 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
SLC27A3Q5K4L6 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
SLC27A3Q5K4L6 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
SLC27A3Q5K4L6 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC30.04■■■□□ 2.4
SLC27A3Q5K4L6 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
SLC27A3Q5K4L6 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
SLC27A3Q5K4L6 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
SLC27A3Q5K4L6 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
SLC27A3Q5K4L6 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
SLC27A3Q5K4L6 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
SLC27A3Q5K4L6 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
SLC27A3Q5K4L6 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
SLC27A3Q5K4L6 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
SLC27A3Q5K4L6 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
SLC27A3Q5K4L6 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
SLC27A3Q5K4L6 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC30.01■■■□□ 2.39
SLC27A3Q5K4L6 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC30.01■■■□□ 2.39
SLC27A3Q5K4L6 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
SLC27A3Q5K4L6 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
SLC27A3Q5K4L6 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
SLC27A3Q5K4L6 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
SLC27A3Q5K4L6 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
SLC27A3Q5K4L6 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
SLC27A3Q5K4L6 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
SLC27A3Q5K4L6 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
SLC27A3Q5K4L6 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
SLC27A3Q5K4L6 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
SLC27A3Q5K4L6 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
SLC27A3Q5K4L6 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
SLC27A3Q5K4L6 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
SLC27A3Q5K4L6 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
SLC27A3Q5K4L6 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC29.99■■■□□ 2.39
SLC27A3Q5K4L6 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
SLC27A3Q5K4L6 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
SLC27A3Q5K4L6 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
SLC27A3Q5K4L6 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
SLC27A3Q5K4L6 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
SLC27A3Q5K4L6 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC29.98■■■□□ 2.39
SLC27A3Q5K4L6 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
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