Protein–RNA interactions for Protein: Q5JV73

FRMPD3, FERM and PDZ domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,810 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMPD3Q5JV73 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
FRMPD3Q5JV73 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
FRMPD3Q5JV73 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
FRMPD3Q5JV73 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
FRMPD3Q5JV73 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
FRMPD3Q5JV73 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
FRMPD3Q5JV73 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
FRMPD3Q5JV73 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
FRMPD3Q5JV73 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
FRMPD3Q5JV73 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
FRMPD3Q5JV73 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
FRMPD3Q5JV73 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
FRMPD3Q5JV73 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
FRMPD3Q5JV73 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
FRMPD3Q5JV73 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
FRMPD3Q5JV73 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
FRMPD3Q5JV73 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
FRMPD3Q5JV73 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
FRMPD3Q5JV73 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
FRMPD3Q5JV73 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
FRMPD3Q5JV73 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
FRMPD3Q5JV73 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
FRMPD3Q5JV73 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
FRMPD3Q5JV73 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
FRMPD3Q5JV73 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
FRMPD3Q5JV73 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
FRMPD3Q5JV73 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
FRMPD3Q5JV73 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
FRMPD3Q5JV73 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
FRMPD3Q5JV73 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
FRMPD3Q5JV73 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
FRMPD3Q5JV73 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
FRMPD3Q5JV73 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
FRMPD3Q5JV73 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
FRMPD3Q5JV73 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
FRMPD3Q5JV73 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
FRMPD3Q5JV73 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
FRMPD3Q5JV73 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
FRMPD3Q5JV73 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
FRMPD3Q5JV73 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
FRMPD3Q5JV73 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
FRMPD3Q5JV73 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
FRMPD3Q5JV73 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
FRMPD3Q5JV73 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
FRMPD3Q5JV73 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
FRMPD3Q5JV73 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
FRMPD3Q5JV73 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
FRMPD3Q5JV73 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
FRMPD3Q5JV73 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
FRMPD3Q5JV73 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
FRMPD3Q5JV73 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
FRMPD3Q5JV73 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
FRMPD3Q5JV73 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
FRMPD3Q5JV73 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
FRMPD3Q5JV73 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
FRMPD3Q5JV73 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
FRMPD3Q5JV73 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
FRMPD3Q5JV73 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
FRMPD3Q5JV73 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
FRMPD3Q5JV73 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
FRMPD3Q5JV73 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
FRMPD3Q5JV73 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
FRMPD3Q5JV73 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
FRMPD3Q5JV73 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
FRMPD3Q5JV73 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
FRMPD3Q5JV73 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
FRMPD3Q5JV73 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
FRMPD3Q5JV73 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
FRMPD3Q5JV73 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
FRMPD3Q5JV73 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
FRMPD3Q5JV73 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC26.17■■□□□ 1.78
FRMPD3Q5JV73 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
FRMPD3Q5JV73 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
FRMPD3Q5JV73 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
FRMPD3Q5JV73 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
FRMPD3Q5JV73 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
FRMPD3Q5JV73 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
FRMPD3Q5JV73 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
FRMPD3Q5JV73 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
FRMPD3Q5JV73 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
FRMPD3Q5JV73 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
FRMPD3Q5JV73 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
FRMPD3Q5JV73 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
FRMPD3Q5JV73 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
FRMPD3Q5JV73 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
FRMPD3Q5JV73 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
FRMPD3Q5JV73 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.77
FRMPD3Q5JV73 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.77
FRMPD3Q5JV73 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
FRMPD3Q5JV73 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
FRMPD3Q5JV73 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
FRMPD3Q5JV73 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
FRMPD3Q5JV73 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC26.13■■□□□ 1.77
FRMPD3Q5JV73 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
FRMPD3Q5JV73 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
FRMPD3Q5JV73 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
FRMPD3Q5JV73 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
FRMPD3Q5JV73 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
FRMPD3Q5JV73 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
FRMPD3Q5JV73 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms