Protein–RNA interactions for Protein: Q5JRX3

PITRM1, Presequence protease, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 1,037 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITRM1Q5JRX3 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PITRM1Q5JRX3 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PITRM1Q5JRX3 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PITRM1Q5JRX3 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PITRM1Q5JRX3 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PITRM1Q5JRX3 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PITRM1Q5JRX3 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PITRM1Q5JRX3 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PITRM1Q5JRX3 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PITRM1Q5JRX3 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PITRM1Q5JRX3 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PITRM1Q5JRX3 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PITRM1Q5JRX3 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PITRM1Q5JRX3 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PITRM1Q5JRX3 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PITRM1Q5JRX3 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PITRM1Q5JRX3 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PITRM1Q5JRX3 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PITRM1Q5JRX3 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PITRM1Q5JRX3 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PITRM1Q5JRX3 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PITRM1Q5JRX3 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PITRM1Q5JRX3 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PITRM1Q5JRX3 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PITRM1Q5JRX3 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
PITRM1Q5JRX3 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PITRM1Q5JRX3 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
PITRM1Q5JRX3 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
PITRM1Q5JRX3 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PITRM1Q5JRX3 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PITRM1Q5JRX3 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PITRM1Q5JRX3 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PITRM1Q5JRX3 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PITRM1Q5JRX3 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PITRM1Q5JRX3 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PITRM1Q5JRX3 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PITRM1Q5JRX3 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
PITRM1Q5JRX3 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PITRM1Q5JRX3 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PITRM1Q5JRX3 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
PITRM1Q5JRX3 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
PITRM1Q5JRX3 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PITRM1Q5JRX3 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PITRM1Q5JRX3 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
PITRM1Q5JRX3 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PITRM1Q5JRX3 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PITRM1Q5JRX3 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PITRM1Q5JRX3 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
PITRM1Q5JRX3 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PITRM1Q5JRX3 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
PITRM1Q5JRX3 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PITRM1Q5JRX3 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PITRM1Q5JRX3 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PITRM1Q5JRX3 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PITRM1Q5JRX3 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PITRM1Q5JRX3 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PITRM1Q5JRX3 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PITRM1Q5JRX3 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PITRM1Q5JRX3 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PITRM1Q5JRX3 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PITRM1Q5JRX3 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PITRM1Q5JRX3 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PITRM1Q5JRX3 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PITRM1Q5JRX3 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PITRM1Q5JRX3 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PITRM1Q5JRX3 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PITRM1Q5JRX3 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PITRM1Q5JRX3 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PITRM1Q5JRX3 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PITRM1Q5JRX3 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PITRM1Q5JRX3 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PITRM1Q5JRX3 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PITRM1Q5JRX3 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PITRM1Q5JRX3 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PITRM1Q5JRX3 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PITRM1Q5JRX3 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PITRM1Q5JRX3 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PITRM1Q5JRX3 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PITRM1Q5JRX3 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PITRM1Q5JRX3 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PITRM1Q5JRX3 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
PITRM1Q5JRX3 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PITRM1Q5JRX3 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PITRM1Q5JRX3 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PITRM1Q5JRX3 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PITRM1Q5JRX3 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PITRM1Q5JRX3 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PITRM1Q5JRX3 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
PITRM1Q5JRX3 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PITRM1Q5JRX3 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PITRM1Q5JRX3 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PITRM1Q5JRX3 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PITRM1Q5JRX3 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PITRM1Q5JRX3 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PITRM1Q5JRX3 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PITRM1Q5JRX3 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PITRM1Q5JRX3 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PITRM1Q5JRX3 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PITRM1Q5JRX3 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PITRM1Q5JRX3 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms