Protein–RNA interactions for Protein: Q5EBM0

CMPK2, UMP-CMP kinase 2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMPK2Q5EBM0 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CMPK2Q5EBM0 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CMPK2Q5EBM0 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CMPK2Q5EBM0 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CMPK2Q5EBM0 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CMPK2Q5EBM0 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CMPK2Q5EBM0 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CMPK2Q5EBM0 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CMPK2Q5EBM0 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
CMPK2Q5EBM0 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CMPK2Q5EBM0 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CMPK2Q5EBM0 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CMPK2Q5EBM0 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CMPK2Q5EBM0 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CMPK2Q5EBM0 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CMPK2Q5EBM0 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CMPK2Q5EBM0 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CMPK2Q5EBM0 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CMPK2Q5EBM0 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CMPK2Q5EBM0 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CMPK2Q5EBM0 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CMPK2Q5EBM0 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CMPK2Q5EBM0 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CMPK2Q5EBM0 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CMPK2Q5EBM0 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CMPK2Q5EBM0 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CMPK2Q5EBM0 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CMPK2Q5EBM0 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CMPK2Q5EBM0 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CMPK2Q5EBM0 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CMPK2Q5EBM0 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CMPK2Q5EBM0 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CMPK2Q5EBM0 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CMPK2Q5EBM0 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CMPK2Q5EBM0 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CMPK2Q5EBM0 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CMPK2Q5EBM0 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CMPK2Q5EBM0 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CMPK2Q5EBM0 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CMPK2Q5EBM0 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CMPK2Q5EBM0 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CMPK2Q5EBM0 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CMPK2Q5EBM0 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CMPK2Q5EBM0 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CMPK2Q5EBM0 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CMPK2Q5EBM0 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CMPK2Q5EBM0 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CMPK2Q5EBM0 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CMPK2Q5EBM0 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CMPK2Q5EBM0 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CMPK2Q5EBM0 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CMPK2Q5EBM0 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CMPK2Q5EBM0 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CMPK2Q5EBM0 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CMPK2Q5EBM0 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CMPK2Q5EBM0 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CMPK2Q5EBM0 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CMPK2Q5EBM0 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CMPK2Q5EBM0 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CMPK2Q5EBM0 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CMPK2Q5EBM0 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CMPK2Q5EBM0 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CMPK2Q5EBM0 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CMPK2Q5EBM0 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CMPK2Q5EBM0 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CMPK2Q5EBM0 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CMPK2Q5EBM0 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CMPK2Q5EBM0 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CMPK2Q5EBM0 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CMPK2Q5EBM0 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CMPK2Q5EBM0 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CMPK2Q5EBM0 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CMPK2Q5EBM0 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CMPK2Q5EBM0 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CMPK2Q5EBM0 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CMPK2Q5EBM0 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CMPK2Q5EBM0 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CMPK2Q5EBM0 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CMPK2Q5EBM0 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CMPK2Q5EBM0 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CMPK2Q5EBM0 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CMPK2Q5EBM0 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CMPK2Q5EBM0 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CMPK2Q5EBM0 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CMPK2Q5EBM0 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CMPK2Q5EBM0 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CMPK2Q5EBM0 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CMPK2Q5EBM0 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CMPK2Q5EBM0 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CMPK2Q5EBM0 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CMPK2Q5EBM0 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CMPK2Q5EBM0 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CMPK2Q5EBM0 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CMPK2Q5EBM0 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CMPK2Q5EBM0 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CMPK2Q5EBM0 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CMPK2Q5EBM0 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CMPK2Q5EBM0 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CMPK2Q5EBM0 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CMPK2Q5EBM0 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57 ms