Protein–RNA interactions for Protein: Q5BKX8

CAVIN4, Caveolae-associated protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN4Q5BKX8 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CAVIN4Q5BKX8 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CAVIN4Q5BKX8 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CAVIN4Q5BKX8 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CAVIN4Q5BKX8 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CAVIN4Q5BKX8 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CAVIN4Q5BKX8 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CAVIN4Q5BKX8 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CAVIN4Q5BKX8 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CAVIN4Q5BKX8 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
CAVIN4Q5BKX8 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CAVIN4Q5BKX8 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CAVIN4Q5BKX8 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CAVIN4Q5BKX8 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CAVIN4Q5BKX8 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CAVIN4Q5BKX8 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CAVIN4Q5BKX8 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CAVIN4Q5BKX8 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CAVIN4Q5BKX8 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
CAVIN4Q5BKX8 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CAVIN4Q5BKX8 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CAVIN4Q5BKX8 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CAVIN4Q5BKX8 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CAVIN4Q5BKX8 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CAVIN4Q5BKX8 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CAVIN4Q5BKX8 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CAVIN4Q5BKX8 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CAVIN4Q5BKX8 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CAVIN4Q5BKX8 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CAVIN4Q5BKX8 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
CAVIN4Q5BKX8 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CAVIN4Q5BKX8 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
CAVIN4Q5BKX8 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CAVIN4Q5BKX8 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CAVIN4Q5BKX8 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CAVIN4Q5BKX8 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CAVIN4Q5BKX8 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CAVIN4Q5BKX8 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CAVIN4Q5BKX8 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CAVIN4Q5BKX8 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CAVIN4Q5BKX8 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
CAVIN4Q5BKX8 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CAVIN4Q5BKX8 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CAVIN4Q5BKX8 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CAVIN4Q5BKX8 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CAVIN4Q5BKX8 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CAVIN4Q5BKX8 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CAVIN4Q5BKX8 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CAVIN4Q5BKX8 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CAVIN4Q5BKX8 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
CAVIN4Q5BKX8 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CAVIN4Q5BKX8 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CAVIN4Q5BKX8 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CAVIN4Q5BKX8 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CAVIN4Q5BKX8 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
CAVIN4Q5BKX8 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CAVIN4Q5BKX8 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CAVIN4Q5BKX8 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CAVIN4Q5BKX8 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CAVIN4Q5BKX8 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CAVIN4Q5BKX8 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CAVIN4Q5BKX8 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CAVIN4Q5BKX8 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CAVIN4Q5BKX8 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CAVIN4Q5BKX8 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CAVIN4Q5BKX8 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CAVIN4Q5BKX8 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CAVIN4Q5BKX8 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CAVIN4Q5BKX8 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
CAVIN4Q5BKX8 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CAVIN4Q5BKX8 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CAVIN4Q5BKX8 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CAVIN4Q5BKX8 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
CAVIN4Q5BKX8 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
CAVIN4Q5BKX8 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
CAVIN4Q5BKX8 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
CAVIN4Q5BKX8 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CAVIN4Q5BKX8 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CAVIN4Q5BKX8 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CAVIN4Q5BKX8 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CAVIN4Q5BKX8 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CAVIN4Q5BKX8 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CAVIN4Q5BKX8 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CAVIN4Q5BKX8 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CAVIN4Q5BKX8 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CAVIN4Q5BKX8 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CAVIN4Q5BKX8 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CAVIN4Q5BKX8 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CAVIN4Q5BKX8 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
CAVIN4Q5BKX8 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CAVIN4Q5BKX8 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CAVIN4Q5BKX8 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CAVIN4Q5BKX8 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CAVIN4Q5BKX8 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CAVIN4Q5BKX8 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CAVIN4Q5BKX8 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CAVIN4Q5BKX8 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CAVIN4Q5BKX8 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CAVIN4Q5BKX8 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
CAVIN4Q5BKX8 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms