Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZIN3

TMEM259, Membralin, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM259Q4ZIN3 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
TMEM259Q4ZIN3 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
TMEM259Q4ZIN3 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMEM259Q4ZIN3 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMEM259Q4ZIN3 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMEM259Q4ZIN3 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMEM259Q4ZIN3 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMEM259Q4ZIN3 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMEM259Q4ZIN3 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMEM259Q4ZIN3 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMEM259Q4ZIN3 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMEM259Q4ZIN3 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMEM259Q4ZIN3 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
TMEM259Q4ZIN3 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMEM259Q4ZIN3 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMEM259Q4ZIN3 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMEM259Q4ZIN3 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMEM259Q4ZIN3 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TMEM259Q4ZIN3 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TMEM259Q4ZIN3 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TMEM259Q4ZIN3 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TMEM259Q4ZIN3 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TMEM259Q4ZIN3 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TMEM259Q4ZIN3 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TMEM259Q4ZIN3 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMEM259Q4ZIN3 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMEM259Q4ZIN3 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMEM259Q4ZIN3 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
TMEM259Q4ZIN3 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMEM259Q4ZIN3 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMEM259Q4ZIN3 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMEM259Q4ZIN3 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMEM259Q4ZIN3 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMEM259Q4ZIN3 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMEM259Q4ZIN3 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMEM259Q4ZIN3 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMEM259Q4ZIN3 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
TMEM259Q4ZIN3 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
TMEM259Q4ZIN3 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TMEM259Q4ZIN3 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TMEM259Q4ZIN3 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TMEM259Q4ZIN3 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TMEM259Q4ZIN3 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TMEM259Q4ZIN3 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TMEM259Q4ZIN3 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
TMEM259Q4ZIN3 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TMEM259Q4ZIN3 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TMEM259Q4ZIN3 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TMEM259Q4ZIN3 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TMEM259Q4ZIN3 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TMEM259Q4ZIN3 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TMEM259Q4ZIN3 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TMEM259Q4ZIN3 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TMEM259Q4ZIN3 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
TMEM259Q4ZIN3 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
TMEM259Q4ZIN3 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TMEM259Q4ZIN3 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TMEM259Q4ZIN3 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TMEM259Q4ZIN3 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TMEM259Q4ZIN3 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TMEM259Q4ZIN3 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TMEM259Q4ZIN3 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TMEM259Q4ZIN3 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
TMEM259Q4ZIN3 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TMEM259Q4ZIN3 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TMEM259Q4ZIN3 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TMEM259Q4ZIN3 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TMEM259Q4ZIN3 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TMEM259Q4ZIN3 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TMEM259Q4ZIN3 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TMEM259Q4ZIN3 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TMEM259Q4ZIN3 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TMEM259Q4ZIN3 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TMEM259Q4ZIN3 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
TMEM259Q4ZIN3 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMEM259Q4ZIN3 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMEM259Q4ZIN3 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMEM259Q4ZIN3 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMEM259Q4ZIN3 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMEM259Q4ZIN3 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
TMEM259Q4ZIN3 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMEM259Q4ZIN3 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMEM259Q4ZIN3 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
TMEM259Q4ZIN3 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMEM259Q4ZIN3 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TMEM259Q4ZIN3 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TMEM259Q4ZIN3 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TMEM259Q4ZIN3 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TMEM259Q4ZIN3 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TMEM259Q4ZIN3 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TMEM259Q4ZIN3 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TMEM259Q4ZIN3 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TMEM259Q4ZIN3 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TMEM259Q4ZIN3 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TMEM259Q4ZIN3 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TMEM259Q4ZIN3 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TMEM259Q4ZIN3 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TMEM259Q4ZIN3 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TMEM259Q4ZIN3 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TMEM259Q4ZIN3 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms