Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0W2

DUSP28, Dual specificity phosphatase 28, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP28Q4G0W2 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
DUSP28Q4G0W2 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
DUSP28Q4G0W2 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
DUSP28Q4G0W2 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
DUSP28Q4G0W2 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
DUSP28Q4G0W2 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
DUSP28Q4G0W2 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
DUSP28Q4G0W2 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
DUSP28Q4G0W2 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
DUSP28Q4G0W2 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
DUSP28Q4G0W2 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
DUSP28Q4G0W2 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
DUSP28Q4G0W2 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
DUSP28Q4G0W2 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
DUSP28Q4G0W2 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
DUSP28Q4G0W2 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
DUSP28Q4G0W2 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
DUSP28Q4G0W2 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
DUSP28Q4G0W2 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
DUSP28Q4G0W2 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
DUSP28Q4G0W2 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
DUSP28Q4G0W2 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
DUSP28Q4G0W2 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
DUSP28Q4G0W2 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
DUSP28Q4G0W2 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
DUSP28Q4G0W2 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
DUSP28Q4G0W2 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
DUSP28Q4G0W2 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
DUSP28Q4G0W2 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
DUSP28Q4G0W2 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
DUSP28Q4G0W2 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
DUSP28Q4G0W2 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
DUSP28Q4G0W2 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
DUSP28Q4G0W2 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
DUSP28Q4G0W2 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
DUSP28Q4G0W2 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
DUSP28Q4G0W2 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
DUSP28Q4G0W2 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
DUSP28Q4G0W2 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
DUSP28Q4G0W2 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
DUSP28Q4G0W2 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
DUSP28Q4G0W2 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
DUSP28Q4G0W2 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
DUSP28Q4G0W2 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
DUSP28Q4G0W2 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
DUSP28Q4G0W2 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
DUSP28Q4G0W2 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
DUSP28Q4G0W2 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
DUSP28Q4G0W2 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
DUSP28Q4G0W2 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
DUSP28Q4G0W2 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
DUSP28Q4G0W2 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
DUSP28Q4G0W2 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
DUSP28Q4G0W2 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
DUSP28Q4G0W2 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
DUSP28Q4G0W2 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
DUSP28Q4G0W2 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
DUSP28Q4G0W2 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
DUSP28Q4G0W2 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
DUSP28Q4G0W2 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
DUSP28Q4G0W2 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
DUSP28Q4G0W2 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
DUSP28Q4G0W2 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
DUSP28Q4G0W2 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
DUSP28Q4G0W2 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
DUSP28Q4G0W2 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
DUSP28Q4G0W2 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
DUSP28Q4G0W2 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
DUSP28Q4G0W2 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
DUSP28Q4G0W2 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
DUSP28Q4G0W2 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
DUSP28Q4G0W2 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
DUSP28Q4G0W2 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
DUSP28Q4G0W2 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
DUSP28Q4G0W2 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
DUSP28Q4G0W2 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
DUSP28Q4G0W2 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
DUSP28Q4G0W2 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
DUSP28Q4G0W2 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
DUSP28Q4G0W2 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
DUSP28Q4G0W2 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
DUSP28Q4G0W2 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
DUSP28Q4G0W2 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
DUSP28Q4G0W2 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
DUSP28Q4G0W2 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
DUSP28Q4G0W2 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
DUSP28Q4G0W2 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
DUSP28Q4G0W2 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
DUSP28Q4G0W2 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
DUSP28Q4G0W2 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
DUSP28Q4G0W2 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
DUSP28Q4G0W2 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
DUSP28Q4G0W2 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
DUSP28Q4G0W2 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
DUSP28Q4G0W2 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
DUSP28Q4G0W2 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
DUSP28Q4G0W2 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
DUSP28Q4G0W2 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
DUSP28Q4G0W2 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
DUSP28Q4G0W2 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.6 ms