Protein–RNA interactions for Protein: Q49B96

COX19, Cytochrome c oxidase assembly protein COX19, humanhuman

Predictions only

Length 90 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX19Q49B96 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
COX19Q49B96 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
COX19Q49B96 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
COX19Q49B96 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
COX19Q49B96 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
COX19Q49B96 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
COX19Q49B96 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
COX19Q49B96 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
COX19Q49B96 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
COX19Q49B96 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
COX19Q49B96 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
COX19Q49B96 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
COX19Q49B96 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
COX19Q49B96 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
COX19Q49B96 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
COX19Q49B96 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
COX19Q49B96 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
COX19Q49B96 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
COX19Q49B96 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
COX19Q49B96 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
COX19Q49B96 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
COX19Q49B96 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
COX19Q49B96 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
COX19Q49B96 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
COX19Q49B96 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
COX19Q49B96 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
COX19Q49B96 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
COX19Q49B96 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
COX19Q49B96 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
COX19Q49B96 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
COX19Q49B96 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
COX19Q49B96 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
COX19Q49B96 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
COX19Q49B96 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
COX19Q49B96 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
COX19Q49B96 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
COX19Q49B96 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
COX19Q49B96 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
COX19Q49B96 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
COX19Q49B96 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
COX19Q49B96 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
COX19Q49B96 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
COX19Q49B96 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
COX19Q49B96 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
COX19Q49B96 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
COX19Q49B96 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
COX19Q49B96 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
COX19Q49B96 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
COX19Q49B96 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
COX19Q49B96 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
COX19Q49B96 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
COX19Q49B96 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
COX19Q49B96 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
COX19Q49B96 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
COX19Q49B96 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
COX19Q49B96 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
COX19Q49B96 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
COX19Q49B96 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
COX19Q49B96 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
COX19Q49B96 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
COX19Q49B96 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
COX19Q49B96 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
COX19Q49B96 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
COX19Q49B96 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
COX19Q49B96 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
COX19Q49B96 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
COX19Q49B96 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
COX19Q49B96 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
COX19Q49B96 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
COX19Q49B96 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
COX19Q49B96 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
COX19Q49B96 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
COX19Q49B96 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
COX19Q49B96 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
COX19Q49B96 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
COX19Q49B96 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
COX19Q49B96 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
COX19Q49B96 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
COX19Q49B96 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
COX19Q49B96 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
COX19Q49B96 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
COX19Q49B96 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
COX19Q49B96 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
COX19Q49B96 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
COX19Q49B96 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
COX19Q49B96 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
COX19Q49B96 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
COX19Q49B96 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
COX19Q49B96 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
COX19Q49B96 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
COX19Q49B96 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
COX19Q49B96 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
COX19Q49B96 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
COX19Q49B96 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
COX19Q49B96 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
COX19Q49B96 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
COX19Q49B96 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
COX19Q49B96 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
COX19Q49B96 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
COX19Q49B96 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms