Protein–RNA interactions for Protein: Q3YBR2

TBRG1, Transforming growth factor beta regulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBRG1Q3YBR2 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TBRG1Q3YBR2 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TBRG1Q3YBR2 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TBRG1Q3YBR2 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TBRG1Q3YBR2 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TBRG1Q3YBR2 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TBRG1Q3YBR2 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TBRG1Q3YBR2 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TBRG1Q3YBR2 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TBRG1Q3YBR2 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TBRG1Q3YBR2 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TBRG1Q3YBR2 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TBRG1Q3YBR2 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TBRG1Q3YBR2 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TBRG1Q3YBR2 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TBRG1Q3YBR2 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TBRG1Q3YBR2 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TBRG1Q3YBR2 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TBRG1Q3YBR2 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TBRG1Q3YBR2 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TBRG1Q3YBR2 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TBRG1Q3YBR2 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TBRG1Q3YBR2 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TBRG1Q3YBR2 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TBRG1Q3YBR2 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TBRG1Q3YBR2 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TBRG1Q3YBR2 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TBRG1Q3YBR2 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TBRG1Q3YBR2 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TBRG1Q3YBR2 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TBRG1Q3YBR2 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TBRG1Q3YBR2 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TBRG1Q3YBR2 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TBRG1Q3YBR2 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TBRG1Q3YBR2 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TBRG1Q3YBR2 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TBRG1Q3YBR2 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TBRG1Q3YBR2 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TBRG1Q3YBR2 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TBRG1Q3YBR2 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TBRG1Q3YBR2 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TBRG1Q3YBR2 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TBRG1Q3YBR2 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TBRG1Q3YBR2 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TBRG1Q3YBR2 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TBRG1Q3YBR2 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TBRG1Q3YBR2 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
TBRG1Q3YBR2 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TBRG1Q3YBR2 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TBRG1Q3YBR2 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
TBRG1Q3YBR2 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TBRG1Q3YBR2 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TBRG1Q3YBR2 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TBRG1Q3YBR2 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TBRG1Q3YBR2 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TBRG1Q3YBR2 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TBRG1Q3YBR2 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TBRG1Q3YBR2 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
TBRG1Q3YBR2 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
TBRG1Q3YBR2 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
TBRG1Q3YBR2 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TBRG1Q3YBR2 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
TBRG1Q3YBR2 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TBRG1Q3YBR2 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
TBRG1Q3YBR2 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TBRG1Q3YBR2 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TBRG1Q3YBR2 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TBRG1Q3YBR2 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TBRG1Q3YBR2 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TBRG1Q3YBR2 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TBRG1Q3YBR2 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TBRG1Q3YBR2 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TBRG1Q3YBR2 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TBRG1Q3YBR2 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TBRG1Q3YBR2 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TBRG1Q3YBR2 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TBRG1Q3YBR2 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TBRG1Q3YBR2 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TBRG1Q3YBR2 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TBRG1Q3YBR2 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TBRG1Q3YBR2 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TBRG1Q3YBR2 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TBRG1Q3YBR2 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
TBRG1Q3YBR2 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
TBRG1Q3YBR2 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TBRG1Q3YBR2 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
TBRG1Q3YBR2 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TBRG1Q3YBR2 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TBRG1Q3YBR2 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TBRG1Q3YBR2 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TBRG1Q3YBR2 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TBRG1Q3YBR2 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TBRG1Q3YBR2 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TBRG1Q3YBR2 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TBRG1Q3YBR2 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
TBRG1Q3YBR2 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TBRG1Q3YBR2 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TBRG1Q3YBR2 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TBRG1Q3YBR2 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TBRG1Q3YBR2 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms