Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYG4

BBS9, Protein PTHB1, humanhuman

Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS9Q3SYG4 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
BBS9Q3SYG4 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
BBS9Q3SYG4 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
BBS9Q3SYG4 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
BBS9Q3SYG4 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
BBS9Q3SYG4 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
BBS9Q3SYG4 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
BBS9Q3SYG4 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
BBS9Q3SYG4 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
BBS9Q3SYG4 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
BBS9Q3SYG4 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
BBS9Q3SYG4 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
BBS9Q3SYG4 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
BBS9Q3SYG4 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
BBS9Q3SYG4 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
BBS9Q3SYG4 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
BBS9Q3SYG4 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
BBS9Q3SYG4 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
BBS9Q3SYG4 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
BBS9Q3SYG4 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
BBS9Q3SYG4 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
BBS9Q3SYG4 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
BBS9Q3SYG4 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
BBS9Q3SYG4 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
BBS9Q3SYG4 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
BBS9Q3SYG4 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
BBS9Q3SYG4 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
BBS9Q3SYG4 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
BBS9Q3SYG4 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
BBS9Q3SYG4 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
BBS9Q3SYG4 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
BBS9Q3SYG4 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
BBS9Q3SYG4 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
BBS9Q3SYG4 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
BBS9Q3SYG4 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
BBS9Q3SYG4 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
BBS9Q3SYG4 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
BBS9Q3SYG4 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
BBS9Q3SYG4 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
BBS9Q3SYG4 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
BBS9Q3SYG4 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
BBS9Q3SYG4 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
BBS9Q3SYG4 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
BBS9Q3SYG4 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
BBS9Q3SYG4 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
BBS9Q3SYG4 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
BBS9Q3SYG4 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
BBS9Q3SYG4 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
BBS9Q3SYG4 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
BBS9Q3SYG4 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
BBS9Q3SYG4 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
BBS9Q3SYG4 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
BBS9Q3SYG4 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
BBS9Q3SYG4 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
BBS9Q3SYG4 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
BBS9Q3SYG4 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
BBS9Q3SYG4 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
BBS9Q3SYG4 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
BBS9Q3SYG4 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
BBS9Q3SYG4 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
BBS9Q3SYG4 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
BBS9Q3SYG4 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
BBS9Q3SYG4 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
BBS9Q3SYG4 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
BBS9Q3SYG4 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
BBS9Q3SYG4 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
BBS9Q3SYG4 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
BBS9Q3SYG4 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
BBS9Q3SYG4 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
BBS9Q3SYG4 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
BBS9Q3SYG4 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
BBS9Q3SYG4 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
BBS9Q3SYG4 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
BBS9Q3SYG4 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
BBS9Q3SYG4 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
BBS9Q3SYG4 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
BBS9Q3SYG4 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
BBS9Q3SYG4 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
BBS9Q3SYG4 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
BBS9Q3SYG4 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
BBS9Q3SYG4 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
BBS9Q3SYG4 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
BBS9Q3SYG4 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
BBS9Q3SYG4 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
BBS9Q3SYG4 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
BBS9Q3SYG4 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
BBS9Q3SYG4 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
BBS9Q3SYG4 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
BBS9Q3SYG4 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
BBS9Q3SYG4 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
BBS9Q3SYG4 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
BBS9Q3SYG4 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
BBS9Q3SYG4 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
BBS9Q3SYG4 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
BBS9Q3SYG4 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
BBS9Q3SYG4 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
BBS9Q3SYG4 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
BBS9Q3SYG4 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
BBS9Q3SYG4 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
BBS9Q3SYG4 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms