Protein–RNA interactions for Protein: Q3LHN1

KRTAP21-3, Keratin-associated protein 21-3, humanhuman

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Length 58 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP21-3Q3LHN1 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
KRTAP21-3Q3LHN1 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
KRTAP21-3Q3LHN1 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
KRTAP21-3Q3LHN1 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
KRTAP21-3Q3LHN1 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
KRTAP21-3Q3LHN1 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
KRTAP21-3Q3LHN1 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
KRTAP21-3Q3LHN1 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
KRTAP21-3Q3LHN1 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
KRTAP21-3Q3LHN1 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
KRTAP21-3Q3LHN1 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC18.82■□□□□ 0.6
KRTAP21-3Q3LHN1 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
KRTAP21-3Q3LHN1 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
KRTAP21-3Q3LHN1 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
KRTAP21-3Q3LHN1 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
KRTAP21-3Q3LHN1 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
KRTAP21-3Q3LHN1 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
KRTAP21-3Q3LHN1 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
KRTAP21-3Q3LHN1 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
KRTAP21-3Q3LHN1 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
KRTAP21-3Q3LHN1 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
KRTAP21-3Q3LHN1 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
KRTAP21-3Q3LHN1 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
KRTAP21-3Q3LHN1 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
KRTAP21-3Q3LHN1 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
KRTAP21-3Q3LHN1 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
KRTAP21-3Q3LHN1 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
KRTAP21-3Q3LHN1 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
KRTAP21-3Q3LHN1 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
KRTAP21-3Q3LHN1 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
KRTAP21-3Q3LHN1 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
KRTAP21-3Q3LHN1 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
KRTAP21-3Q3LHN1 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
KRTAP21-3Q3LHN1 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
KRTAP21-3Q3LHN1 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
KRTAP21-3Q3LHN1 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC18.79■□□□□ 0.6
KRTAP21-3Q3LHN1 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
KRTAP21-3Q3LHN1 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
KRTAP21-3Q3LHN1 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
KRTAP21-3Q3LHN1 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
KRTAP21-3Q3LHN1 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
KRTAP21-3Q3LHN1 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
KRTAP21-3Q3LHN1 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
KRTAP21-3Q3LHN1 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
KRTAP21-3Q3LHN1 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
KRTAP21-3Q3LHN1 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
KRTAP21-3Q3LHN1 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
KRTAP21-3Q3LHN1 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
KRTAP21-3Q3LHN1 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
KRTAP21-3Q3LHN1 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
KRTAP21-3Q3LHN1 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
KRTAP21-3Q3LHN1 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
KRTAP21-3Q3LHN1 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
KRTAP21-3Q3LHN1 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
KRTAP21-3Q3LHN1 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
KRTAP21-3Q3LHN1 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
KRTAP21-3Q3LHN1 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KRTAP21-3Q3LHN1 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
KRTAP21-3Q3LHN1 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KRTAP21-3Q3LHN1 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
KRTAP21-3Q3LHN1 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
KRTAP21-3Q3LHN1 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KRTAP21-3Q3LHN1 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KRTAP21-3Q3LHN1 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KRTAP21-3Q3LHN1 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
KRTAP21-3Q3LHN1 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
KRTAP21-3Q3LHN1 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KRTAP21-3Q3LHN1 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
KRTAP21-3Q3LHN1 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
KRTAP21-3Q3LHN1 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KRTAP21-3Q3LHN1 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KRTAP21-3Q3LHN1 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KRTAP21-3Q3LHN1 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KRTAP21-3Q3LHN1 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KRTAP21-3Q3LHN1 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KRTAP21-3Q3LHN1 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KRTAP21-3Q3LHN1 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KRTAP21-3Q3LHN1 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KRTAP21-3Q3LHN1 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KRTAP21-3Q3LHN1 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KRTAP21-3Q3LHN1 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
KRTAP21-3Q3LHN1 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KRTAP21-3Q3LHN1 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KRTAP21-3Q3LHN1 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KRTAP21-3Q3LHN1 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
KRTAP21-3Q3LHN1 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KRTAP21-3Q3LHN1 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
KRTAP21-3Q3LHN1 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KRTAP21-3Q3LHN1 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
KRTAP21-3Q3LHN1 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
KRTAP21-3Q3LHN1 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
KRTAP21-3Q3LHN1 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
KRTAP21-3Q3LHN1 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
KRTAP21-3Q3LHN1 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
KRTAP21-3Q3LHN1 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
KRTAP21-3Q3LHN1 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
KRTAP21-3Q3LHN1 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
KRTAP21-3Q3LHN1 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
KRTAP21-3Q3LHN1 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
KRTAP21-3Q3LHN1 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
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