Protein–RNA interactions for Protein: Q3KP44

ANKRD55, Ankyrin repeat domain-containing protein 55, humanhuman

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD55Q3KP44 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ANKRD55Q3KP44 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ANKRD55Q3KP44 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ANKRD55Q3KP44 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ANKRD55Q3KP44 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ANKRD55Q3KP44 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ANKRD55Q3KP44 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ANKRD55Q3KP44 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ANKRD55Q3KP44 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ANKRD55Q3KP44 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ANKRD55Q3KP44 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ANKRD55Q3KP44 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ANKRD55Q3KP44 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ANKRD55Q3KP44 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ANKRD55Q3KP44 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ANKRD55Q3KP44 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ANKRD55Q3KP44 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ANKRD55Q3KP44 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ANKRD55Q3KP44 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ANKRD55Q3KP44 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ANKRD55Q3KP44 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ANKRD55Q3KP44 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ANKRD55Q3KP44 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ANKRD55Q3KP44 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ANKRD55Q3KP44 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ANKRD55Q3KP44 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ANKRD55Q3KP44 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ANKRD55Q3KP44 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ANKRD55Q3KP44 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ANKRD55Q3KP44 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ANKRD55Q3KP44 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ANKRD55Q3KP44 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ANKRD55Q3KP44 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ANKRD55Q3KP44 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ANKRD55Q3KP44 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ANKRD55Q3KP44 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ANKRD55Q3KP44 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ANKRD55Q3KP44 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ANKRD55Q3KP44 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ANKRD55Q3KP44 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ANKRD55Q3KP44 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ANKRD55Q3KP44 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ANKRD55Q3KP44 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ANKRD55Q3KP44 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ANKRD55Q3KP44 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ANKRD55Q3KP44 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ANKRD55Q3KP44 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ANKRD55Q3KP44 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ANKRD55Q3KP44 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ANKRD55Q3KP44 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ANKRD55Q3KP44 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ANKRD55Q3KP44 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ANKRD55Q3KP44 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ANKRD55Q3KP44 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ANKRD55Q3KP44 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ANKRD55Q3KP44 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ANKRD55Q3KP44 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
ANKRD55Q3KP44 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ANKRD55Q3KP44 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ANKRD55Q3KP44 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ANKRD55Q3KP44 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ANKRD55Q3KP44 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ANKRD55Q3KP44 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ANKRD55Q3KP44 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ANKRD55Q3KP44 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ANKRD55Q3KP44 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ANKRD55Q3KP44 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ANKRD55Q3KP44 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ANKRD55Q3KP44 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
ANKRD55Q3KP44 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
ANKRD55Q3KP44 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
ANKRD55Q3KP44 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
ANKRD55Q3KP44 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
ANKRD55Q3KP44 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
ANKRD55Q3KP44 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
ANKRD55Q3KP44 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
ANKRD55Q3KP44 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
ANKRD55Q3KP44 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ANKRD55Q3KP44 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
ANKRD55Q3KP44 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
ANKRD55Q3KP44 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC19.27■□□□□ 0.67
ANKRD55Q3KP44 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ANKRD55Q3KP44 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ANKRD55Q3KP44 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ANKRD55Q3KP44 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ANKRD55Q3KP44 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ANKRD55Q3KP44 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ANKRD55Q3KP44 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ANKRD55Q3KP44 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ANKRD55Q3KP44 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ANKRD55Q3KP44 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
ANKRD55Q3KP44 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ANKRD55Q3KP44 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ANKRD55Q3KP44 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ANKRD55Q3KP44 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ANKRD55Q3KP44 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ANKRD55Q3KP44 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ANKRD55Q3KP44 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
ANKRD55Q3KP44 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ANKRD55Q3KP44 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms