Protein–RNA interactions for Protein: Q2TAL6

VWC2, Brorin, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWC2Q2TAL6 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VWC2Q2TAL6 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VWC2Q2TAL6 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VWC2Q2TAL6 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VWC2Q2TAL6 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VWC2Q2TAL6 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VWC2Q2TAL6 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VWC2Q2TAL6 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VWC2Q2TAL6 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VWC2Q2TAL6 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VWC2Q2TAL6 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VWC2Q2TAL6 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VWC2Q2TAL6 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VWC2Q2TAL6 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
VWC2Q2TAL6 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VWC2Q2TAL6 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VWC2Q2TAL6 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VWC2Q2TAL6 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VWC2Q2TAL6 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
VWC2Q2TAL6 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VWC2Q2TAL6 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VWC2Q2TAL6 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VWC2Q2TAL6 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VWC2Q2TAL6 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
VWC2Q2TAL6 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VWC2Q2TAL6 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
VWC2Q2TAL6 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VWC2Q2TAL6 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VWC2Q2TAL6 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VWC2Q2TAL6 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
VWC2Q2TAL6 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
VWC2Q2TAL6 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
VWC2Q2TAL6 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
VWC2Q2TAL6 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
VWC2Q2TAL6 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
VWC2Q2TAL6 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
VWC2Q2TAL6 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
VWC2Q2TAL6 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
VWC2Q2TAL6 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
VWC2Q2TAL6 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
VWC2Q2TAL6 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
VWC2Q2TAL6 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
VWC2Q2TAL6 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
VWC2Q2TAL6 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
VWC2Q2TAL6 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
VWC2Q2TAL6 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
VWC2Q2TAL6 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
VWC2Q2TAL6 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
VWC2Q2TAL6 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
VWC2Q2TAL6 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
VWC2Q2TAL6 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
VWC2Q2TAL6 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
VWC2Q2TAL6 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
VWC2Q2TAL6 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
VWC2Q2TAL6 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
VWC2Q2TAL6 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
VWC2Q2TAL6 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
VWC2Q2TAL6 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
VWC2Q2TAL6 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
VWC2Q2TAL6 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
VWC2Q2TAL6 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
VWC2Q2TAL6 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
VWC2Q2TAL6 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
VWC2Q2TAL6 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
VWC2Q2TAL6 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
VWC2Q2TAL6 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
VWC2Q2TAL6 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
VWC2Q2TAL6 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
VWC2Q2TAL6 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
VWC2Q2TAL6 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
VWC2Q2TAL6 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
VWC2Q2TAL6 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
VWC2Q2TAL6 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
VWC2Q2TAL6 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
VWC2Q2TAL6 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
VWC2Q2TAL6 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
VWC2Q2TAL6 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
VWC2Q2TAL6 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
VWC2Q2TAL6 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
VWC2Q2TAL6 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
VWC2Q2TAL6 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
VWC2Q2TAL6 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
VWC2Q2TAL6 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
VWC2Q2TAL6 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
VWC2Q2TAL6 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
VWC2Q2TAL6 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
VWC2Q2TAL6 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
VWC2Q2TAL6 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
VWC2Q2TAL6 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
VWC2Q2TAL6 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
VWC2Q2TAL6 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
VWC2Q2TAL6 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
VWC2Q2TAL6 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
VWC2Q2TAL6 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
VWC2Q2TAL6 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
VWC2Q2TAL6 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
VWC2Q2TAL6 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
VWC2Q2TAL6 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
VWC2Q2TAL6 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
VWC2Q2TAL6 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms