Protein–RNA interactions for Protein: Q2Q1W2

TRIM71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 868 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM71Q2Q1W2 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.72
TRIM71Q2Q1W2 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
TRIM71Q2Q1W2 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRIM71Q2Q1W2 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRIM71Q2Q1W2 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRIM71Q2Q1W2 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRIM71Q2Q1W2 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRIM71Q2Q1W2 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
TRIM71Q2Q1W2 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRIM71Q2Q1W2 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRIM71Q2Q1W2 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRIM71Q2Q1W2 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRIM71Q2Q1W2 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRIM71Q2Q1W2 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRIM71Q2Q1W2 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRIM71Q2Q1W2 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRIM71Q2Q1W2 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRIM71Q2Q1W2 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRIM71Q2Q1W2 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
TRIM71Q2Q1W2 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRIM71Q2Q1W2 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRIM71Q2Q1W2 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRIM71Q2Q1W2 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRIM71Q2Q1W2 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRIM71Q2Q1W2 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRIM71Q2Q1W2 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRIM71Q2Q1W2 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRIM71Q2Q1W2 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRIM71Q2Q1W2 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRIM71Q2Q1W2 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRIM71Q2Q1W2 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRIM71Q2Q1W2 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRIM71Q2Q1W2 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRIM71Q2Q1W2 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRIM71Q2Q1W2 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRIM71Q2Q1W2 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRIM71Q2Q1W2 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRIM71Q2Q1W2 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRIM71Q2Q1W2 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
TRIM71Q2Q1W2 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TRIM71Q2Q1W2 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
TRIM71Q2Q1W2 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
TRIM71Q2Q1W2 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TRIM71Q2Q1W2 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TRIM71Q2Q1W2 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRIM71Q2Q1W2 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRIM71Q2Q1W2 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRIM71Q2Q1W2 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRIM71Q2Q1W2 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRIM71Q2Q1W2 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRIM71Q2Q1W2 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRIM71Q2Q1W2 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRIM71Q2Q1W2 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRIM71Q2Q1W2 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRIM71Q2Q1W2 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRIM71Q2Q1W2 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRIM71Q2Q1W2 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRIM71Q2Q1W2 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRIM71Q2Q1W2 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TRIM71Q2Q1W2 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TRIM71Q2Q1W2 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
TRIM71Q2Q1W2 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TRIM71Q2Q1W2 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
TRIM71Q2Q1W2 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TRIM71Q2Q1W2 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TRIM71Q2Q1W2 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TRIM71Q2Q1W2 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TRIM71Q2Q1W2 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TRIM71Q2Q1W2 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TRIM71Q2Q1W2 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TRIM71Q2Q1W2 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TRIM71Q2Q1W2 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TRIM71Q2Q1W2 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TRIM71Q2Q1W2 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TRIM71Q2Q1W2 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRIM71Q2Q1W2 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRIM71Q2Q1W2 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRIM71Q2Q1W2 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRIM71Q2Q1W2 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
TRIM71Q2Q1W2 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TRIM71Q2Q1W2 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TRIM71Q2Q1W2 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TRIM71Q2Q1W2 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
TRIM71Q2Q1W2 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
TRIM71Q2Q1W2 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
TRIM71Q2Q1W2 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
TRIM71Q2Q1W2 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
TRIM71Q2Q1W2 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
TRIM71Q2Q1W2 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
TRIM71Q2Q1W2 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRIM71Q2Q1W2 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRIM71Q2Q1W2 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRIM71Q2Q1W2 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRIM71Q2Q1W2 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRIM71Q2Q1W2 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRIM71Q2Q1W2 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRIM71Q2Q1W2 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRIM71Q2Q1W2 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRIM71Q2Q1W2 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRIM71Q2Q1W2 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.4 ms