Protein–RNA interactions for Protein: Q2NKQ1

SGSM1, Small G protein signaling modulator 1, humanhuman

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Length 1,148 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGSM1Q2NKQ1 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SGSM1Q2NKQ1 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SGSM1Q2NKQ1 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SGSM1Q2NKQ1 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SGSM1Q2NKQ1 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SGSM1Q2NKQ1 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SGSM1Q2NKQ1 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SGSM1Q2NKQ1 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SGSM1Q2NKQ1 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SGSM1Q2NKQ1 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
SGSM1Q2NKQ1 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SGSM1Q2NKQ1 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SGSM1Q2NKQ1 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SGSM1Q2NKQ1 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SGSM1Q2NKQ1 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SGSM1Q2NKQ1 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SGSM1Q2NKQ1 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SGSM1Q2NKQ1 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SGSM1Q2NKQ1 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SGSM1Q2NKQ1 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SGSM1Q2NKQ1 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SGSM1Q2NKQ1 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SGSM1Q2NKQ1 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SGSM1Q2NKQ1 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SGSM1Q2NKQ1 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SGSM1Q2NKQ1 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SGSM1Q2NKQ1 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SGSM1Q2NKQ1 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SGSM1Q2NKQ1 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SGSM1Q2NKQ1 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SGSM1Q2NKQ1 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SGSM1Q2NKQ1 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SGSM1Q2NKQ1 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SGSM1Q2NKQ1 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SGSM1Q2NKQ1 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SGSM1Q2NKQ1 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SGSM1Q2NKQ1 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SGSM1Q2NKQ1 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SGSM1Q2NKQ1 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
SGSM1Q2NKQ1 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SGSM1Q2NKQ1 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SGSM1Q2NKQ1 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SGSM1Q2NKQ1 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SGSM1Q2NKQ1 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SGSM1Q2NKQ1 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SGSM1Q2NKQ1 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SGSM1Q2NKQ1 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SGSM1Q2NKQ1 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SGSM1Q2NKQ1 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SGSM1Q2NKQ1 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SGSM1Q2NKQ1 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SGSM1Q2NKQ1 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SGSM1Q2NKQ1 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SGSM1Q2NKQ1 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
SGSM1Q2NKQ1 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
SGSM1Q2NKQ1 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SGSM1Q2NKQ1 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SGSM1Q2NKQ1 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SGSM1Q2NKQ1 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SGSM1Q2NKQ1 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SGSM1Q2NKQ1 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SGSM1Q2NKQ1 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SGSM1Q2NKQ1 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SGSM1Q2NKQ1 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SGSM1Q2NKQ1 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SGSM1Q2NKQ1 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SGSM1Q2NKQ1 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
SGSM1Q2NKQ1 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SGSM1Q2NKQ1 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SGSM1Q2NKQ1 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SGSM1Q2NKQ1 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SGSM1Q2NKQ1 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SGSM1Q2NKQ1 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SGSM1Q2NKQ1 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SGSM1Q2NKQ1 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SGSM1Q2NKQ1 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SGSM1Q2NKQ1 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SGSM1Q2NKQ1 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SGSM1Q2NKQ1 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SGSM1Q2NKQ1 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SGSM1Q2NKQ1 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SGSM1Q2NKQ1 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SGSM1Q2NKQ1 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SGSM1Q2NKQ1 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SGSM1Q2NKQ1 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SGSM1Q2NKQ1 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SGSM1Q2NKQ1 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SGSM1Q2NKQ1 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SGSM1Q2NKQ1 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SGSM1Q2NKQ1 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SGSM1Q2NKQ1 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SGSM1Q2NKQ1 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SGSM1Q2NKQ1 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SGSM1Q2NKQ1 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SGSM1Q2NKQ1 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SGSM1Q2NKQ1 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SGSM1Q2NKQ1 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SGSM1Q2NKQ1 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SGSM1Q2NKQ1 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC25■■□□□ 1.59
SGSM1Q2NKQ1 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
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