Protein–RNA interactions for Protein: Q2M329

CCDC96, Coiled-coil domain-containing protein 96, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC96Q2M329 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
CCDC96Q2M329 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCDC96Q2M329 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCDC96Q2M329 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCDC96Q2M329 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCDC96Q2M329 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC96Q2M329 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC96Q2M329 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC96Q2M329 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC96Q2M329 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC96Q2M329 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC96Q2M329 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC96Q2M329 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC96Q2M329 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC96Q2M329 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC96Q2M329 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
CCDC96Q2M329 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
CCDC96Q2M329 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
CCDC96Q2M329 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CCDC96Q2M329 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CCDC96Q2M329 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CCDC96Q2M329 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CCDC96Q2M329 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CCDC96Q2M329 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CCDC96Q2M329 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CCDC96Q2M329 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC96Q2M329 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC96Q2M329 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC96Q2M329 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC96Q2M329 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC96Q2M329 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC96Q2M329 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC96Q2M329 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC96Q2M329 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC96Q2M329 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC96Q2M329 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC96Q2M329 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC96Q2M329 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC96Q2M329 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC96Q2M329 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC96Q2M329 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC96Q2M329 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC96Q2M329 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC96Q2M329 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC96Q2M329 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC96Q2M329 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC96Q2M329 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC96Q2M329 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC96Q2M329 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC96Q2M329 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC96Q2M329 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC96Q2M329 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC96Q2M329 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC96Q2M329 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC96Q2M329 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC96Q2M329 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC96Q2M329 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC96Q2M329 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC96Q2M329 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC96Q2M329 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC96Q2M329 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CCDC96Q2M329 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CCDC96Q2M329 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CCDC96Q2M329 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CCDC96Q2M329 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
CCDC96Q2M329 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CCDC96Q2M329 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC96Q2M329 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC96Q2M329 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC96Q2M329 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC96Q2M329 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC96Q2M329 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC96Q2M329 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC96Q2M329 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC96Q2M329 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC96Q2M329 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC96Q2M329 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC96Q2M329 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC96Q2M329 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC96Q2M329 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC96Q2M329 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC96Q2M329 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC96Q2M329 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC96Q2M329 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC96Q2M329 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC96Q2M329 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC96Q2M329 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC96Q2M329 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC96Q2M329 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC96Q2M329 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC96Q2M329 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC96Q2M329 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC96Q2M329 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC96Q2M329 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC96Q2M329 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC96Q2M329 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC96Q2M329 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC96Q2M329 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC96Q2M329 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC96Q2M329 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms