Protein–RNA interactions for Protein: Q16831

UPP1, Uridine phosphorylase 1, humanhuman

Predictions only

Length 310 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPP1Q16831 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
UPP1Q16831 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
UPP1Q16831 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
UPP1Q16831 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
UPP1Q16831 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
UPP1Q16831 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
UPP1Q16831 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
UPP1Q16831 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
UPP1Q16831 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
UPP1Q16831 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
UPP1Q16831 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
UPP1Q16831 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
UPP1Q16831 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
UPP1Q16831 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
UPP1Q16831 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
UPP1Q16831 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
UPP1Q16831 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
UPP1Q16831 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
UPP1Q16831 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
UPP1Q16831 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
UPP1Q16831 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
UPP1Q16831 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
UPP1Q16831 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
UPP1Q16831 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
UPP1Q16831 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
UPP1Q16831 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
UPP1Q16831 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
UPP1Q16831 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
UPP1Q16831 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
UPP1Q16831 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
UPP1Q16831 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
UPP1Q16831 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
UPP1Q16831 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
UPP1Q16831 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
UPP1Q16831 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
UPP1Q16831 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
UPP1Q16831 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
UPP1Q16831 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
UPP1Q16831 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
UPP1Q16831 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
UPP1Q16831 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
UPP1Q16831 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
UPP1Q16831 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
UPP1Q16831 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
UPP1Q16831 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
UPP1Q16831 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
UPP1Q16831 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
UPP1Q16831 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
UPP1Q16831 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
UPP1Q16831 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
UPP1Q16831 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
UPP1Q16831 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
UPP1Q16831 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
UPP1Q16831 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
UPP1Q16831 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
UPP1Q16831 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
UPP1Q16831 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
UPP1Q16831 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
UPP1Q16831 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
UPP1Q16831 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
UPP1Q16831 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
UPP1Q16831 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
UPP1Q16831 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
UPP1Q16831 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
UPP1Q16831 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
UPP1Q16831 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
UPP1Q16831 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
UPP1Q16831 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
UPP1Q16831 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
UPP1Q16831 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
UPP1Q16831 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
UPP1Q16831 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
UPP1Q16831 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
UPP1Q16831 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
UPP1Q16831 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
UPP1Q16831 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
UPP1Q16831 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
UPP1Q16831 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
UPP1Q16831 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
UPP1Q16831 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
UPP1Q16831 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
UPP1Q16831 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
UPP1Q16831 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
UPP1Q16831 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
UPP1Q16831 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
UPP1Q16831 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
UPP1Q16831 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
UPP1Q16831 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
UPP1Q16831 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
UPP1Q16831 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
UPP1Q16831 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
UPP1Q16831 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
UPP1Q16831 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
UPP1Q16831 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
UPP1Q16831 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
UPP1Q16831 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
UPP1Q16831 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
UPP1Q16831 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
UPP1Q16831 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
UPP1Q16831 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms