Protein–RNA interactions for Protein: Q16720

ATP2B3, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B3Q16720 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
ATP2B3Q16720 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
ATP2B3Q16720 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
ATP2B3Q16720 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
ATP2B3Q16720 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
ATP2B3Q16720 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
ATP2B3Q16720 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
ATP2B3Q16720 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
ATP2B3Q16720 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
ATP2B3Q16720 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
ATP2B3Q16720 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
ATP2B3Q16720 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
ATP2B3Q16720 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
ATP2B3Q16720 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
ATP2B3Q16720 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
ATP2B3Q16720 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
ATP2B3Q16720 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
ATP2B3Q16720 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
ATP2B3Q16720 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
ATP2B3Q16720 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
ATP2B3Q16720 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
ATP2B3Q16720 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
ATP2B3Q16720 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
ATP2B3Q16720 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
ATP2B3Q16720 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
ATP2B3Q16720 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
ATP2B3Q16720 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
ATP2B3Q16720 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
ATP2B3Q16720 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
ATP2B3Q16720 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
ATP2B3Q16720 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
ATP2B3Q16720 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
ATP2B3Q16720 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
ATP2B3Q16720 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
ATP2B3Q16720 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC28.68■■■□□ 2.18
ATP2B3Q16720 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
ATP2B3Q16720 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
ATP2B3Q16720 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
ATP2B3Q16720 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
ATP2B3Q16720 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
ATP2B3Q16720 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
ATP2B3Q16720 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
ATP2B3Q16720 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
ATP2B3Q16720 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
ATP2B3Q16720 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
ATP2B3Q16720 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
ATP2B3Q16720 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
ATP2B3Q16720 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
ATP2B3Q16720 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
ATP2B3Q16720 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
ATP2B3Q16720 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
ATP2B3Q16720 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
ATP2B3Q16720 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
ATP2B3Q16720 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
ATP2B3Q16720 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
ATP2B3Q16720 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
ATP2B3Q16720 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
ATP2B3Q16720 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
ATP2B3Q16720 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
ATP2B3Q16720 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
ATP2B3Q16720 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
ATP2B3Q16720 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
ATP2B3Q16720 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
ATP2B3Q16720 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.17
ATP2B3Q16720 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.17
ATP2B3Q16720 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
ATP2B3Q16720 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
ATP2B3Q16720 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
ATP2B3Q16720 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
ATP2B3Q16720 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
ATP2B3Q16720 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
ATP2B3Q16720 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
ATP2B3Q16720 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
ATP2B3Q16720 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
ATP2B3Q16720 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
ATP2B3Q16720 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
ATP2B3Q16720 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
ATP2B3Q16720 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
ATP2B3Q16720 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
ATP2B3Q16720 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
ATP2B3Q16720 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
ATP2B3Q16720 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
ATP2B3Q16720 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
ATP2B3Q16720 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
ATP2B3Q16720 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
ATP2B3Q16720 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
ATP2B3Q16720 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
ATP2B3Q16720 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
ATP2B3Q16720 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
ATP2B3Q16720 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
ATP2B3Q16720 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
ATP2B3Q16720 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
ATP2B3Q16720 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
ATP2B3Q16720 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
ATP2B3Q16720 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
ATP2B3Q16720 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
ATP2B3Q16720 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
ATP2B3Q16720 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
ATP2B3Q16720 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
ATP2B3Q16720 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
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