Protein–RNA interactions for Protein: Q16654

PDK4, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 4, mitochondrial, humanhuman

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Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK4Q16654 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDK4Q16654 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PDK4Q16654 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PDK4Q16654 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PDK4Q16654 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PDK4Q16654 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PDK4Q16654 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PDK4Q16654 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDK4Q16654 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDK4Q16654 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDK4Q16654 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDK4Q16654 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PDK4Q16654 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PDK4Q16654 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PDK4Q16654 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PDK4Q16654 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PDK4Q16654 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PDK4Q16654 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PDK4Q16654 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PDK4Q16654 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PDK4Q16654 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PDK4Q16654 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PDK4Q16654 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PDK4Q16654 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PDK4Q16654 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PDK4Q16654 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PDK4Q16654 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PDK4Q16654 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PDK4Q16654 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PDK4Q16654 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PDK4Q16654 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PDK4Q16654 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PDK4Q16654 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PDK4Q16654 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PDK4Q16654 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PDK4Q16654 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PDK4Q16654 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PDK4Q16654 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PDK4Q16654 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PDK4Q16654 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PDK4Q16654 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PDK4Q16654 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PDK4Q16654 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PDK4Q16654 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PDK4Q16654 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PDK4Q16654 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
PDK4Q16654 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PDK4Q16654 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PDK4Q16654 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
PDK4Q16654 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PDK4Q16654 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PDK4Q16654 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
PDK4Q16654 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PDK4Q16654 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PDK4Q16654 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PDK4Q16654 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PDK4Q16654 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PDK4Q16654 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PDK4Q16654 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PDK4Q16654 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PDK4Q16654 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PDK4Q16654 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PDK4Q16654 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PDK4Q16654 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PDK4Q16654 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
PDK4Q16654 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PDK4Q16654 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PDK4Q16654 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PDK4Q16654 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PDK4Q16654 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PDK4Q16654 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
PDK4Q16654 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PDK4Q16654 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PDK4Q16654 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PDK4Q16654 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PDK4Q16654 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PDK4Q16654 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PDK4Q16654 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PDK4Q16654 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
PDK4Q16654 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PDK4Q16654 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PDK4Q16654 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PDK4Q16654 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PDK4Q16654 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PDK4Q16654 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PDK4Q16654 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PDK4Q16654 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
PDK4Q16654 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PDK4Q16654 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PDK4Q16654 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PDK4Q16654 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PDK4Q16654 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PDK4Q16654 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PDK4Q16654 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PDK4Q16654 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PDK4Q16654 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PDK4Q16654 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PDK4Q16654 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PDK4Q16654 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PDK4Q16654 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
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