Protein–RNA interactions for Protein: Q16647

PTGIS, Prostacyclin synthase, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGISQ16647 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PTGISQ16647 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PTGISQ16647 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PTGISQ16647 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PTGISQ16647 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
PTGISQ16647 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PTGISQ16647 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
PTGISQ16647 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PTGISQ16647 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
PTGISQ16647 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PTGISQ16647 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PTGISQ16647 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PTGISQ16647 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
PTGISQ16647 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PTGISQ16647 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PTGISQ16647 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
PTGISQ16647 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PTGISQ16647 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PTGISQ16647 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PTGISQ16647 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PTGISQ16647 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PTGISQ16647 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PTGISQ16647 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PTGISQ16647 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PTGISQ16647 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PTGISQ16647 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PTGISQ16647 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PTGISQ16647 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PTGISQ16647 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
PTGISQ16647 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PTGISQ16647 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PTGISQ16647 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PTGISQ16647 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PTGISQ16647 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PTGISQ16647 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PTGISQ16647 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PTGISQ16647 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PTGISQ16647 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PTGISQ16647 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PTGISQ16647 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PTGISQ16647 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PTGISQ16647 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PTGISQ16647 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
PTGISQ16647 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PTGISQ16647 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PTGISQ16647 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PTGISQ16647 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PTGISQ16647 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PTGISQ16647 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PTGISQ16647 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PTGISQ16647 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PTGISQ16647 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PTGISQ16647 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PTGISQ16647 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PTGISQ16647 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PTGISQ16647 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PTGISQ16647 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PTGISQ16647 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PTGISQ16647 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PTGISQ16647 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PTGISQ16647 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PTGISQ16647 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
PTGISQ16647 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PTGISQ16647 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PTGISQ16647 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PTGISQ16647 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PTGISQ16647 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PTGISQ16647 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PTGISQ16647 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PTGISQ16647 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PTGISQ16647 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PTGISQ16647 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
PTGISQ16647 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PTGISQ16647 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PTGISQ16647 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PTGISQ16647 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PTGISQ16647 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PTGISQ16647 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PTGISQ16647 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PTGISQ16647 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PTGISQ16647 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PTGISQ16647 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PTGISQ16647 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PTGISQ16647 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PTGISQ16647 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PTGISQ16647 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PTGISQ16647 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PTGISQ16647 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PTGISQ16647 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PTGISQ16647 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PTGISQ16647 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
PTGISQ16647 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PTGISQ16647 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
PTGISQ16647 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PTGISQ16647 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
PTGISQ16647 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PTGISQ16647 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PTGISQ16647 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PTGISQ16647 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PTGISQ16647 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms